Phylogeny and molecular delineation of leiognathids in the Southeast coastal waters of India

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 5

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_INJBIR-1-1_004

تاریخ نمایه سازی: 26 مرداد 1404

چکیده مقاله:

DNA barcoding is very useful in identification of animal species and resolving taxonomic ambiguity of morphologically similar animals. The aim of the present study was to investigate molecular identification of like Leiognathid fishes based on cytochrome c oxidase I (COI) gene sequence. Molecular level identification and comparison of six species from four genera of Leiognatidae were done. Results showed that A + T content of Leiognathids ranged from ۵۵.۲۷ to ۵۳.۳۲%. Mean genetic diversity within the species and overall species diversity within the family were calculated to be ۰.۰۰۴ and ۰.۱۷۸, respectively. Maximum K۲P genetic distance (۰.۲۵۵) was observed between Gazza minuta and Leiognathus equulus. We obtained a monophyletic phylogenetic tree for Leiognathids with two major clades. One major clade contained only Gazza, and Eubleekeria, Karalla and Leiognathus, were grouped under another clade. Genus Leiognathus, which is not sexually dimorphic, get clustered as a separate sub-clade. Thus COI gene sequence could be used for species identification and delineation of complex groups like Leiognathids.

نویسندگان

V.G. Anil Kumar

Centre of Advanced Study in Marine Biology, Faculty of Marine Sciences, Annamalai University, Parangipettai, Tamil Nadu - ۶۰۸ ۵۰۲, India.

A. Kartick

Centre of Advanced Study in Marine Biology, Faculty of Marine Sciences, Annamalai University, Parangipettai, Tamil Nadu - ۶۰۸ ۵۰۲, India.

M. Thangaraj

Centre of Advanced Study in Marine Biology, Faculty of Marine Sciences, Annamalai University, Parangipettai, Tamil Nadu - ۶۰۸ ۵۰۲, India.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Azaz, S., Pradeep, M., Jyoti, J and S.K., ۲۰۲۱. New ...
  • Banu, F., Remanadevi, V., Shalini, G. and Thangaraj, M., ۲۰۲۰. ...
  • Bhattacharya, M., Chkraborty, C., Patra, B.C., Sharma, A.R., Sharma, G., ...
  • Bookstein, F.L., Chernoff, B., Elder, R.L., Humphries, J.M., Smith, G.R. ...
  • Candek, K. and Kuntner, M.Z., ۲۰۱۵. DNA barcoding gap: reliable ...
  • Chakrabarty, P. and Sparks, J.S. ۲۰۰۷. Phylogeny and taxonomic revision ...
  • Chakrabarty, P., Sparks, J. and Ho, H.C., ۲۰۱۰. Taxonomic review ...
  • Chakrabarty, P., Davis, M., Smith, W., Berquist, R., Gledhill, K., ...
  • Culverhouse, P.F., Williams, R., Reguera, B., Herry, V. and Gonzalez-Gil, ...
  • Dasmahapatra, K.K. and Mallet, J., ۲۰۰۶. Taxonomy: DNA barcodes: recent ...
  • En, L.Y., Abdullah, S., Tan, M.P., Ghaffar, M.A., Alias, M. ...
  • Eschmeyer, W.N., Fricke, R., Laan, V.R. (eds), ۲۰۱۶.Catalogue of fishes: ...
  • Hajibabaei, M., Singer, G.A.C., Hebert, P.D.N. and Hickey, D.A., ۲۰۰۷. ...
  • Hebert, P.D.N., Cywinska, A., Ball, S.L. and DeWaard, J.R., ۲۰۰۳. ...
  • Hebert, P.D.N., Stoeckle, M.Y., Zemlak, T.S. and Francis, C.M., ۲۰۰۴. ...
  • Ikejima, K., Ishiguro, N., Wada, M., Tsukamoto, K. and Nishida, ...
  • Jawad, L.A.J. and Al-Mamry, J.M., ۲۰۱۳. New record of the ...
  • Ko, H.L., Wang, Y.T., Chiu, T.S., Lee, M.A., Leu, M.Y., ...
  • Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C. and Tamura, ...
  • Lakra, W.S., Verma, M.S., Goswami, M., Lal, K.K., Mohindra, V., ...
  • Ludt, W.B., Jabado, R.W., Hameli, S.M., Freeman, L., Teruyama, G. ...
  • Mazlan, A.G. and Seah, Y.G. ۲۰۰۶. Meristic and length-weight relationship ...
  • Meier, R., Zhang, G. and Ali, F. ۲۰۰۸. The use ...
  • Meyer, C.P. and Paulay, G. ۲۰۰۵. DNA barcoding: error rate ...
  • Sachithanandam, V. and Mohan, P.M. ۲۰۲۰. A review on DNA ...
  • Saitou, N. and Nei, M. ۱۹۸۷. The neighbor-joining method: a ...
  • Sambrook, J., Fritch, E.F. and Maniatis, T. ۱۹۸۹. Molecular Cloning: ...
  • Seah, Y.G., Ghaffar, M.A. and Usup, G. ۲۰۰۸. Molecular phylogeny ...
  • Seah, Y.G., Usup, G., Mohamed, C.A.R., Arshad, A. and Mazlan, ...
  • Seah, Y.G., Ariffin, A. and Nurul, A.T. ۲۰۱۷. Levels of ...
  • Seth, J.K., Barik, T.K. and Choudhury, R.C. ۲۰۱۶. Karyomorphometry of ...
  • Seth, J.K. and Barik, T.K. ۲۰۲۱. DNA Barcoding of the ...
  • Sparks, J.S. and Dunlap, P.V. ۲۰۰۴. A clade of non-sexually ...
  • Sparks, J., Dunalp, P. and Smith, W. ۲۰۰۵. Evolution and ...
  • Ward, R.D., Zemlak, T.S., Innes, B.H., Last, P.R. and Hebert, ...
  • Woodland, D.J., Premcharoen, S. and Cabanban, A.S. ۲۰۰۱. Leiognathidae.Slipmouths (ponyfishes). ...
  • Zhang, J. and Hanner, R. ۲۰۱۱. DNA barcoding is a ...
  • نمایش کامل مراجع