شناسایی و کشف آلل های ژنهای چند آللی با استفاده از همردیفی چند توالی و ماتریس دو دویی

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,398

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0909

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

در سالهای اخیر مطالعات ژنتیکی متعددی با استفاده از روش های مختلف روی ژن های چندآللی صورت گرفته است که به علت تشابهات فراوان میان آلل های یک ژن این مطالعات همیشه از پیچیدگی خاصی برخوردار بوده است و نیاز به وقت و هزینه فراوان دارد. خلاء روشی که بتواند با هزینه و زمان کمتر نتایجی دقیق تر را ارائه دهد همیشه محسوس بوده است. روشی که در این مقاله آورده شده، روشی ابتکاری بوده و در یکی از پر آلل ترین ژنهای چند آللی یعنی S-RNAse مسئول فرآیند ناسازگاری در خانواده Rosaceae را مورد مطالعه قرار داده است که با استفاده از همردیفی چندتایی توالی آلل ها سپس تشکیل ماتریس و بانک داده ای دودویی توانست در م دتی کوتاه تمامی آلل های موجود در جمعیت هدف را شناسایی نماید. تمامی آلل های 101، 102 ، 103، 104، 105، 106، 107، 108، 110، 114، 118 و 119 در جمعیت هدف که شامل کولتیوارهای Bartlett, Spadona, Docteur Jules Guyot, Harrow delight, Burre Giffard, Honey Sweet, Harrow Sweet, General Leclerc, Coscia, Doyenne du comice, Beurre Bosc, Beurre Hardy, conference و passé crassane است شناسایی شدند.

کلیدواژه ها:

ژنهای چندآللی- همردیفی چندتایی-S-RNAse- خودناسازگاری- ماتریس دودویی

نویسندگان

احسان زنگنه

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات

محمود خسروشاهلی

مدیر گروه بیوتکنولوژی و عضو هیئت علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Anderson, M.A., Cornish, E.C., Mau, S.L., Williams, E.G., Hoggart, R., ...
  • Anton, Y., 2007. Methods In molecular biology 402, PCR Primer ...
  • Ausubel, F, M., Brent, R., Kingston R, E., Moore, D, ...
  • Barnes, M.R., Gray, I.C., 2003. Bioinformatics for Genetics. John Wiley ...
  • Broothaerts, W., Janssens, G.A., Proost, P., Broekaert, W.F., 1995. cDNA ...
  • Brown, T.A., 2007. Genomes3 3" Editin. Garland Science ...
  • Doyle, J.J., Doyle, D.J, 1987. A rapid DNA isolation procedure ...
  • Entani, T., Takayama, S., Isogai, A., 2003. Molecular mechanism of ...
  • Goldway, M., Yasuda, T, T., Sanzol, J., Mota, M., Zisovich, ...
  • Goldway, M., Sapir, G., Stern, R.A., 2007. Molecular basis and ...
  • Howe, C., 2007. Gene Cloning and Manipulation. Cambridge. University Press. ...
  • Kao, T.H., Tsukamoto, T., 2004. The molecular and genetic bases ...
  • Mendenhall. W., R. J. Beaver, B. M. Beaver, 1999. Introduction ...
  • Mota, M., Tavares, L, Oliveira, C.M., 2007. Identification of S-alleles ...
  • Sambrook, J., Fritsch, E.F., Maniatis, T., 1989. Molecular Cloning. Cold ...
  • Sanzol, J., Herrero, M., 2002. Identification of s elf- incompatibility ...
  • Sanzol, J., Herrero, M., 2007. S elf- incompatibility and s ...
  • Sanzol, J., Robbins, T.P., 2008. Combined analysis of s alleles ...
  • Sanzol, J., Sutherland, B.G., Robbins, T.P., 2006. Identification and _ ...
  • Takasaki, T., Moriya, Y., Okada, K., Yamamoto, K., Iwanami, H. ...
  • Takayama, S., Isogai, A., 2005. S elf-incompatib lity in plants. ...
  • Ushijima, K., Sassa, H., Tao, R., Yamane, H., Dandekar, A.M., ...
  • Zisovich, A.H., Stern, R.A., Shafir, S., Goldway, M., 2004. Identification ...
  • Zuccherelli, S., Tassinari, P., Broothaerts, W., Tartarini, S., Dondini, L., ...
  • Sexual Plant Reproduction 15, 153-158. ...
  • نمایش کامل مراجع