تعیین توالی ژنومی شش جدایه Streptomyces از خاکهای استان کرمان
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 608
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0892
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
استرپتومیستها باکتریها گرم مثبت، هوازی، رشته ای و غیر متحرک هستند. در این پروژه پنجاه ایزوله از استرپتومیستهای خاکهای مناطق مختلف کرمان جداسازی و بمنظور تولید نانوپارتیکل های طلا ارزیابی شدند. از بین آنها، شش ایزوله فعال انتخاب و مطالعات مولکولی تعیین توالی ژنهای آنها انجام پذیرفت. بررسی مشابهت توالی این ژنها با توالیهای موجود در بانک ژن، در پایگاه NCBI، با استفاده از جستجوی بلاست، مشخص نمود که توالی نوکلئوتیدی آنها به ترتیب با توالی نوکلئوتیدی ژن 16S rRNA گونه های گونه های Streptomyces mutabilis strain 13676F (99%) ، Streptomyces sp. 6G6 (99%) ، Streptomyces coelicolor (100%) ، Streptomyces rochei strain T170 (100%) ، Streptomyces violascens strain G8A-24 (100%) ، (Streptomyces virginiae strain TSR37 (100% که از جنسهای خانواده Streptomycetaceae می باشند، بیشترین مشابهت را دارا هستند. توالی نوکلئوتیدی ژنهایی که بیشترین شباهت را با توالی نشان دادند، از پایگاه NCBI اخذف گردید. سپس با استفاده از نرم افزار DNAMAN ماتریس همولوژی و درخت فیلوژنتیکی برای این توالیها و توالی حاصل از ایزوله های فعال مذکور ترسیم شد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سارا بیگلری
بخش مهندسی بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
غلامحسین شهیدی بنجار
بخش مهندسی گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
غلامرضا شریفی سیرچی
بخش مهندسی بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :