تعیین ترادف موقعیت فیلوژنتیکی قطعه RNA-1 جدایه ایرانی ویروس بی بذری گوجه فرنگی
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 727
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0776
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
به منظور مطالعه ژنوم ویروس بی بذری گوجه فرنگی (Tomato aspermy virus, TAV) و مقایسه قطعه RNA-1 جدایه ایرانی این ویروس با دیگر جدایه های گزارش شده در دنیا، طی نمونه برداری از مناطق مختلف کشور در سالهای 1388 تا 1389 آلودگی یک نمونه گیاه اطلسی نسبت به این ویروس در منطقه ماهان استان کرامن به وسیله آزمون الایزا به روش ساندویچ دوطرفه با آنتی سرم چند همساننه ای تأئید شد. آر.ان.ای کل ویروس استخراج و قطعه RNA-1 و ژن 1a این جدایه (Ker.Mah.P) توسط 4 جفت آغازگر اختصاصی در روش RT-PCR تکثیر و سپس همسانه سازی گردیدند. پس از تعیین ترادف، طول قطعه RNA-1 و ژن 1a این جدایه ایرانی به ترتیب معادل 3351 و 2981 نوکلئوتید بدست آمد. جهت تعیین جایگاه تکاملی جدایه Ker.Mah.P با دیگر ترادفهای موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گردیدند. بر اساس درخت تکاملی رسم شده بر پایه ژن 1a جدایه Ker.Mah.P به همراه جدایه های KC-TAV و V-TAV مربوط به کشورهای استرالیا و کره جنوبی به ترتیب با 99/. و 99/2 درصد بیشرین میزان مشابهت را با جدایه ایرانی نشان دادند. همچنین جدایه Ker.Mah.P با 99/2 درصد دارای بیشترین میزان تشابه ترادف نوکلئوتیدی در قطعه RNA-1 با جدایه V-TAV می باشد. نتایج حاصل از این تحقیق تشابه بالای ترادف نوکلئوتیدی و اسیدهای آمینه قطعه RNA-1 و همچنین ژن 1a مربوط به آن را با دیگر جدایه های گزارش شده در دنیا نشان می دهد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محمد مداحیان
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی دانشگاه شهید باهنر کرمان
حسین معصومی
عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
جهانگیر حیدرنژاد
عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
اکبر حسینی پور
عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :