ساختار ژنوم و نکات کلیدی ضروری برای رمزگشایی ژنوم زعفران ( Crocus sativus L. )

ژنوم گیاهان دارای سطحی از سازماندهی زیستی است. با این حال، زمینه ژن و بیان آن نیز باید در رابطه با فنوتیپ کلی یک ارگانیسم در نظر گرفته شود. این مقاله با هدف بررسی مطالعات در زمینه ساختار ژنوم و نکات کلیدی ضروری برای رمزگشایی ژنوم زعفران انجام شد. در طول ۴۰ سال گذشته، ابزارهای مختلفی همراه با رویکردهای اومیکس (ژنومیکس، ترانسکریپتومیکس، پروتئومیکس، متابولومیکس و غیره) به سرعت برای بررسی ساختار و عملکرد ژن توسعه یافته اند. در نتیجه، حجم عظیم داده های تولید شده نیاز به پردازش دارد. ادغام داده های چند اومیکس نه تنها درک ما را از بیان ژن، ساختار و عملکرد ژن پیش می برد، بلکه مهندسی ویرایش و تنظیم ژن و ژنوم را نیز ممکن می سازد. با این وجود، گلوگاه چگونگی استفاده از داده های زعفران است که شامل استراتژی های مناسب و کارآمد برای تولید داده، ذخیره داده، پردازش داده، تحلیل داده و تجسم داده ها می شود. تا به امروز، تلاش های بسیاری برای افزایش دانش ما در مورد ژنوم، ترانسکریپتوم، پروتئوم و متابولوم زعفران انجام شده است و چندین ژن مسئول رنگ، طعم و عطر در زعفران کلون شده اند. در دهه گذشته، توالی های کل ژنوم برای نمایندگان اکثر گروه های اصلی گیاهان به دست آمده است. با این حال، کل ژنوم زعفران به تازگی توالی یابی شده است که می تواند با داده های ترانسکریپتوم، پروتئوم و متابولوم ادغام شود تا اسرار فرآیند زیستی و منشا و والدین نیایی طلای سرخ را آشکار کند. یک پیشنویس با وضوح بالای ژنوم زعفران و در نهایت توالی ژنوم آن ارائه می دهد.

کلیدواژه ها:

ژنوم ، توالی یابی ژنوم ، ابزارهای بیوانفورماتیک ، عوامل رونویسی ، ژن های ارتولوگ ، اصلاح نباتات