ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

بررسی متابولیت ها و مسیرهای بیولوژیکی میکروبیوتا و بازسازی شبکه برهمکنش میکروبیوتا-متابولیت در سرطان روده بزرگ

محل انتشار: فصلنامه زیست فناوری، دوره: 16، شماره: 1
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 160

فایل این مقاله در 19 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2210283

شناسه ملی سند علمی:

JR_BIOT-16-1_005

تاریخ نمایه سازی: 9 فروردین 1404

چکیده مقاله:

پیشرفت­های علمی بطور قابل توجهی درک ما را از ارتباطات پیچیده بین سرطان و میکروبیوم افزایش داده است. آزمایشات تجربی نشان داده ­اند که تعامل میزبان و میکروبیوتا نقش مهمی در سلامتی یا بیماری بدن انسان ایفا می­کند. میکروبیوم انسان دارای مزایای متعددی از جمله تنظیم فرآیندهای اساسی مانند انتقال پیام، ایمنی و متابولیسم هستند که به عملکرد مناسب میزبان کمک می­کند. عدم تعادل میکروبیوتای روده و یا دیس بیوسی با ایجاد و پیشرفت بیماری­های پیچیده مانند سرطان روده بزرگ ارتباط دارد. از اینرو در این پژوهش بر اساس اطلاعات متاژنوم و متابولوم و آنالیزهای عملکردی میکروبیوم روده بزرگ، باکتری­ها، متابولیت­ها و مسیرهای بیولوژیکی باکتریایی مهم در سرطان روده بزرگ(CRC) را در مقایسه با گروه سالم شناسایی کردیم. همچنین سهم باکتریهای مختلف در مسیرهایی با فراوانی معنی­دار را مورد بررسی قرار دادیم و درنهایت با تجزیه و تحلیل شبکه برهمکنش باکتری-متابولیت در دو گروه سالم و سرطان، تفاوت این دو شبکه را از نظر ویژگی­های توپولوژیکی مشخص کردیم. نتایج ما نشانگرهای زیستی بالقوه را برای CRC معرفی کرد که می­توانند در طراحی مطالعات آینده مورد استفاده قرار بگیرند. همچنین نشان داد که بعضی از باکتریها از جمله Bacteroides_fragilis و Bifidobacterium_longum که به ترتیب دارای افزایش و کاهش فراوانی در گروه سرطان هستند، در مسیرهای بیولوژیکی مهم باکتریایی در  CRCنیز مشارکت دارند. این یافته ها در مجموع نشان داد که میکروبیوم روده یک رویکرد غیرتهاجمی امیدوار کننده برای غربالگری اولیه CRC خواهد بود و ترکیب میکروبیوتای روده و متابولیت­های آنها می­تواند اطلاعات مهمی در مورد CRC ارائه دهد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

حسین شهرکی قدیمی

۱. Department of Biophysics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran

پرویز عبدالمالکی

Department of Biophysics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran

سید شهریار عرب

Department of Pediatrics, University of California, San Diego, La Jolla, CA ۹۲۰۹۳, USA

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Kamal, N., Ilowefah, M.A., Hilles, A.R., Anua, N.A., Awin, T., ...
  • Mbemi, A., Khanna, S., Njiki, S., Yedjou, C.G. and Tchounwou, ...
  • Mardis, E.R., ۲۰۱۹. The impact of next-generation sequencing on cancer ...
  • Raza, M.H., Gul, K., Arshad, A., Riaz, N., Waheed, U., ...
  • Dekker, E., Tanis, P.J., Vleugels, J., Kasi, P.M. and Wallace, ...
  • Marcellinaro, R., Spoletini, D., Grieco, M., Avella, P., Cappuccio, M., ...
  • Sninsky, J.A., Shore, B.M., Lupu, G.V. and Crockett, S.D., ۲۰۲۲. ...
  • Rajilić-Stojanović M, de Vos WM. The first ۱۰۰۰ cultured species ...
  • Qin, J., Li, R., Raes, J., Arumugam, M., Burgdorf, K.S., ...
  • Fucarino, A., Burgio, S., Paladino, L., Caruso Bavisotto, C., Pitruzzella, ...
  • Afzaal, M., Saeed, F., Shah, Y.A., Hussain, M., Rabail, R., ...
  • Murphy, N., Moreno, V., Hughes, D.J., Vodicka, L., Vodicka, P., ...
  • Tjalsma, H., Boleij, A., Marchesi, J.R. and Dutilh, B.E., ۲۰۱۲. ...
  • Villéger, R., Lopès, A., Veziant, J., Gagnière, J., Barnich, N., ...
  • Hendler, R. and Zhang, Y., ۲۰۱۸. Probiotics in the treatment ...
  • Yang, Y., Misra, B.B., Liang, L., Bi, D., Weng, W., ...
  • Peng, Y., Nie, Y., Yu, J. and Wong, C.C., ۲۰۲۱. ...
  • Niekamp, P. and Kim, C.H., ۲۰۲۳. Microbial metabolite dysbiosis and ...
  • Wang, X.N., Yin, Y.H., Cheng, X., Chen, L., Chen, M.L., ...
  • Gomes, P.W.P., de Tralia Medeiros, T.C., Maimone, N.M., Leão, T.F., ...
  • Gomes, P.W.P., de Tralia Medeiros, T.C., Maimone, N.M., Leão, T.F., ...
  • Nugent, J.L., McCoy, A.N., Addamo, C.J., Jia, W., Sandler, R.S. ...
  • Proal, A.D., Lindseth, I.A. and Marshall, T.G., ۲۰۱۷. Microbe-microbe and ...
  • Andrighetti, T., Bohar, B., Lemke, N., Sudhakar, P. and Korcsmaros, ...
  • Pavlopoulos, G.A., Secrier, M., Moschopoulos, C.N., Soldatos, T.G., Kossida, S., ...
  • Bauer, E. and Thiele, I., ۲۰۱۸. From network analysis to ...
  • Zackular, J.P., Rogers, M.A., Ruffin IV, M.T. and Schloss, P.D., ...
  • Dulal, S. and Keku, T.O., ۲۰۱۴. Gut microbiome and colorectal ...
  • - Feng, Q., Liang, S., Jia, H., Stadlmayr, A., Tang, ...
  • Haghi, F., Goli, E., Mirzaei, B. and Zeighami, H., ۲۰۱۹. ...
  • Peterson, J., Garges, S., Giovanni, M., McInnes, P., Wang, L., ...
  • Emmert, D.B., Stoehr, P.J., Stoesser, G. and Cameron, G.N., ۱۹۹۴. ...
  • Beghini, F., McIver, L.J., Blanco-Míguez, A., Dubois, L., Asnicar, F., ...
  • Varet, H., Brillet-Guéguen, L., Coppée, J.Y. and Dillies, M.A., ۲۰۱۶. ...
  • Weiss, S., Xu, Z.Z., Peddada, S., Amir, A., Bittinger, K., ...
  • Love, M.I., Huber, W. and Anders, S., ۲۰۱۴. Moderated estimation ...
  • Soofi, A., Taghizadeh, M., Tabatabaei, S.M., Tavirani, M.R., Shakib, H., ...
  • Winterbach, W., Mieghem, P.V., Reinders, M., Wang, H. and Ridder, ...
  • Goenawan, I.H., Bryan, K. and Lynn, D.J., ۲۰۱۶. DyNet: visualization ...
  • Kohl, M., Wiese, S. and Warscheid, B., ۲۰۱۱. Cytoscape: software ...
  • Yu, J., Feng, Q., Wong, S.H., Zhang, D., yi Liang, ...
  • Dai, Z., Coker, O.O., Nakatsu, G., Wu, W.K., Zhao, L., ...
  • Martin-Gallausiaux, C., Marinelli, L., Blottière, H.M., Larraufie, P. and Lapaque, ...
  • Farriol, M., Segovia-Silvestre, T., Castellanos, J.M., Venereo, Y. and Orta, ...
  • Barreiro-Alonso, E., Castro-Estrada, P., Sanchez, M., Peña-Iglesias, P., Suarez, L. ...
  • Chen, C. and Li, H., ۲۰۲۰. The inhibitory effect of ...
  • Long, J., Guan, P., Hu, X., Yang, L., He, L., ...
  • Yan, L., Spitznagel, E.L. and Bosland, M.C., ۲۰۱۰. Soy consumption ...
  • Lv, J., Jin, S., Zhang, Y., Zhou, Y., Li, M. ...
  • Du, P., Tseng, Y., Liu, P., Zhang, H., Huang, G. ...
  • Thomas, A.M., Jesus, E.C., Lopes, A., Aguiar Jr, S., Begnami, ...
  • He, T., Cheng, X. and Xing, C., ۲۰۲۱. The gut ...
  • Xu, S., Yin, W., Zhang, Y., Lv, Q., Yang, Y. ...
  • Weir, T.L., Manter, D.K., Sheflin, A.M., Barnett, B.A., Heuberger, A.L. ...
  • Purcell, R.V., Pearson, J., Aitchison, A., Dixon, L., Frizelle, F.A. ...
  • Cheng, W.T., Kantilal, H.K. and Davamani, F., ۲۰۲۰. The mechanism ...
  • Derrien, M., Belzer, C. and de Vos, W.M., ۲۰۱۷. Akkermansia ...
  • N. Sanapareddy, R.M. Legge, B. Jovov, A. McCoy, L. Burcal, ...
  • Kostic, A.D., Gevers, D., Pedamallu, C.S., Michaud, M., Duke, F., ...
  • Han, Y.W., ۲۰۱۵. Fusobacterium nucleatum: a commensal-turned pathogen. Current opinion ...
  • Rubinstein, M.R., Wang, X., Liu, W., Hao, Y., Cai, G. ...
  • Han, Y.W., ۲۰۱۴. Oral bacteria and colorectal cancer: etiology and ...
  • Rubinstein, M.R., Baik, J.E., Lagana, S.M., Han, R.P., Raab, W.J., ...
    • نمایش کامل مراجع