واکنش زنجیره ای پلیمراز دیجیتال قطره ای با استفاده از تراشه میکروفلوئیدیکی

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 10

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_MME-20-8_001

تاریخ نمایه سازی: 22 اسفند 1403

چکیده مقاله:

تحقیقات بر روی DNA در تشخیص، کنترل و درمان بسیاری از بیماری ها ازجمله سرطان اهمیت ویژه ای دارد. امروزه استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز دیجیتال قطره ای (ddPCR) برای آزمایشات مختلف بر روی DNA توجه محققان زیادی را جلب کرده است. برای انجام ddPCR به تعداد زیادی قطره با ابعاد میکرونی نیاز است. در مطالعه حاضر، یک سیستم ddPCR با استفاده از تراشه میکروفلوئیدیکی طراحی، ساخته و ارزیابی شد. این سیستم شامل یک تراشه میکروفلوئیدیکی برای تولید قطره و یک دستگاه تامین کننده چرخه های حرارتی مورد نیاز در PCR است. تولید قطره در ریزتراشه به صورت سه بعدی شبیه سازی شد. نتایج شبیه سازی اعتبارسنجی شد. خطای متوسط در شعاع قطرات تولیدشده حدود ۵% است. دستگاه چرخه حرارتی ساخته شده، دمای تراشه را با دقت ۱/۵±درجه سانتی گراد کنترل می کند. فرآیند PCR درون تراشه با اعمال ۲۵ چرخه حرارتی با موفقیت انجام شد. در اکثر قطرات خاصیت فلورسنت مشاهده شد که اثبات می کند دستگاه چرخه حرارتی شرایط تکثیر DNA را در آزمایشگاه به خوبی فراهم کرده است. تصاویر پردازش و سطوح مختلف نور فلورسنت در قطرات شناسایی شد. ضریب تغییرات قطرات انتخاب شده در برنامه پردازش، برابر با ۲/۵% است که در مقایسه با حالت قابل قبول برای این نوع سیستم ها (کمتر از ۸%) دقت مطلوبی را ارایه می دهد. نتایج به دست آمده از این دستگاه کاملا بومی، می تواند در زمینه های متعددی ازجمله تشخیص سرطان، بررسی بافت سرطانی و ارزیابی موفقیت عمل بافت برداری استفاده شود.

کلیدواژه ها:

Polymerase Chain Reaction ، Microfluidic ، DNA ، Cancer ، واکنش زنجیره ای پلیمراز ، میکروفلوئیدیک ، DNA ، سرطان

نویسندگان

امین بهرامی

Department of Mechanical Engineering, Faculty of Mechanical Engineering, Sharif University of Technology, Tehran, Iran

هاجر مقدس

Department of Mechanical Engineering, Faculty of Gas and Petroleum, Yasouj University, Gachsaran, Iran

محمدسعید سعیدی

Department of Mechanical Engineering, Faculty of Mechanical Engineering, Sharif University of Technology, Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Shemer R, Magenheim J, Dor Y. Digital droplet PCR for ...
  • Cho SM, Shin S, Kim Y, Song W, Hong SG, ...
  • Li C, He Q, Liang H, Cheng B, Li J, ...
  • Olmedillas-López S, García-Arranz M, García-Olmo D. Current and emerging applications ...
  • Chang CH, Mau-Hsu D, Chen KC, Wei CW, Chiu CY, ...
  • Miao G, Zhang L, Zhang J, Ge S, Xia N, ...
  • Kalinina O, Lebedeva I, Brown J, Silver J. Nanoliter scale ...
  • Vogelstein B, Kinzler KW. Digital PCR. Proceedings of the National ...
  • Pekin D, Skhiri Y, Baret JC, Le Corre D, Mazutis ...
  • Perkins G, Lu H, Garlan F, Taly V. Droplet-based digital ...
  • Cordova C, Syeda MM, Corless B, Wiggins JM, Patel A, ...
  • Ramírez JD, Herrera G, Hernandez C, Cruz-Saavedra L, Munoz M, ...
  • Wu W, Zhou S, Hu J, Wang G, Ding X, ...
  • Pan Y, Ma T, Meng Q, Mao Y, Chu K, ...
  • Hatch AC, Fisher JS, Tovar AR, Hsieh AT, Lin R, ...
  • Kiss MM, Ortoleva-Donnelly L, Beer NR, Warner J, Bailey CG, ...
  • Markey AL, Mohr S, Day PJR. High-throughput droplet PCR. Methods. ...
  • Mohr S, Zhang YH, Macaskill A, Day PJR, Barber RW, ...
  • Ochoa A, Trejo F, Olguín LF. Droplet-based microfluidics methods for ...
  • Ergin FG, Watz BB, Gade-Nielsen NF. A review of planar ...
  • Gupta S, Ramesh K, Ahmed S, Kakkar V. Lab-on-chip technology: ...
  • Khoo BL, Grenci G, Lim YB, Lee SC, Han J, ...
  • Lu J, Pang J, Chen Y, Dong Q, Sheng J, ...
  • ngber DE. Integrated human organ-on-chip microphysiological systems [Internet]. Unknown publisher ...
  • Kashaninejad N, Yaghoobi M, Pourhassan‐Moghaddam M, Bazaz SR, Jin D, ...
  • Opalski AS, Kaminski TS, Garstecki P. Droplet microfluidics as a ...
  • Chen R, Sun Z, Chen D. Droplet-based microfluidics for cell ...
  • Ji Q, Zhang JM, Liu Y, Li X, Lv P, ...
  • Jain V, Patrikar RM. A low-cost portable dynamic droplet sensing ...
  • Orejuela JDA. Gas-liquid droplet microfluidics under confined ۳D flow-focusing geometries ...
  • Madic J, Zocevic A, Senlis V, Fradet E, Andre B, ...
  • Maleki MA, Soltani M, Kashaninejad N, Nguyen NT. Effects of ...
  • Doufène K, Tourné-Péteilh C, Etienne P, Aubert-Pouëssel A. Microfluidic systems ...
  • Iqbal S, Bashir S, Ahsan M, Bashir M, Shoukat S. ...
  • Do LQ, Vu QT, Nguyen NC, Nguyen TH, Tran TH, ...
  • نمایش کامل مراجع