انتخاب بیومارکر miR-۱۲۵۴ با استفاده از بیوانفورماتیک و بررسی تغییرات بیان آن در سرطان ریه به روش Real -Time PCR

سرطان سلول غیر کوچک ریه (NSCLC) یکی از کشنده ترین انواع سرطان است که به دلیل متاستاز و مقاومت درمانی، نرخ بقای پایینی دارد. در این راستا، شناسایی بیومارکرها به عنوان شاخص های بیولوژیکی می تواند به بهبود تشخیص و درمان این بیماری کمک کند. microRNAها به عنوان تنظیم کننده های ژنتیکی، نقش مهمی در پیشرفت سرطان ایفا می کنند. هدف این مطالعه بررسی تغییرات بیان microRNA-۱۲۵۴ و تاثیر آن بر مسیرهای مولکولی در بیماران مبتال به NSCLC بود. در این پژوهش، از ابزارهای بیوانفورماتیک برای شناسایی و انتخاب microRNA-۱۲۵۴ استفاده شد. ابتدا، داده های بیان miRNA از پایگاه های داده معتبر مانند TCGA و GEO جمع آوری و پس از پیش پردازش و نرماالیز کردن، miRNAهایی که تغییرات معنی دار در بیان داشتند شناسایی شدند. با استفاده از نرم افزارهای DESeq۲ و edgeR، miRNAهای با تغییرات قابل توجه در بافت های سرطانی نسبت به بافت های سالم بررسی شدند. پیش بینی هدف های احتمالی microRNAها با ابزارهایی مانند TargetScan و miRBase انجام و آنالیزهای Gene Ontology (GO) و تحلیل های KEGG برای شناسایی فرآیندهای بیولوژیکی و مسیرهای سیگنال دهی تحت تاثیر این miRNAها به کار رفت. پس از شبیه سازی و تحلیل ها، ۳۰ نمونه خون محیطی و بافت سرطانی از بیماران NSCLC و ۳۰ نمونه از افراد سالم به عنوان گروه کنترل جمع آوری شد. بیان microRNA-۱۲۵۴ با تکنیک Real-Time PCR سنجیده شد. یافته ها نشان داد که بیان microRNA-۱۲۵۴ به طور قابل توجهی در گروه بیماران NSCLC نسبت به گروه کنترل کاهش یافته است (P < ۰.۰۰۱). این نشان می دهد که microRNA-۱۲۵۴ می تواند به عنوان یک تنظیم کننده منفی عمل کند و نقش مهمی در مهار رشد و تکثیر سلول های سرطانی ایفا کند. همچنین کاربرد ابزارهای بیوانفورماتیک در شناسایی بیومارکرها و تحلیل های مولکولی به پژوهشگران این امکان را می دهد که الگوهای تغییرات ژنتیکی و بیوشیمیایی را شناسایی کنند و به طراحی درمان های هدفمند و شخصی سازی شده برای بیماران کمک کنند. نتایج این مطالعه، اهمیت microRNA-۱۲۵۴ را به عنوان یک بیومارکر مهم و هدف درمانی بالقوه در NSCLC برجسته می کند و می تواند به عنوان ابزاری برای تشخیص زودهنگام و درمان هدفمند سرطان ها مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

سرطان سلولهای غیر کوچک ریه ، miRNA ، Real Time-PCR ، بیوانفورماتیک