مدل سازی و تحلیل ویژگی های ژنومی ویروس های +ssRNA و -ssRNA با بهره گیری از سیگنال های ژنومی و SSTF در یادگیری ماشین

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 132

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICS19_012

تاریخ نمایه سازی: 11 اسفند 1403

چکیده مقاله:

این مقاله به تحلیل و مدل سازی ویژگی های ژنومی ویروس های +ssRNA و -ssRNA با استفاده از سیگنال های ژنومی و تکنیک های SSTF در یادگیری ماشین پرداخته است. داده های ژنومی از سایت KEGG به تعداد ۲۰۰۰ نمونه برای هر دو نوع خانواده ویروس های +ssRNA و -ssRNA دانلود و با استفاده از منحنی Z و SSTF به تصاویر تبدیل شدند. ویژگی های این تصاویر با مدل VGG۱۶ استخراج شده و سپس برای طبقه بندی با مدل های ماشین بردار پشتیبان (SVM) و جنگل تصادفی تحلیل شده اند. نتایج نشان می دهد که مدل جنگل تصادفی با دقت ۹۹ درصد عملکرد بهتری نسبت به مدل SVM با دقت ۷۶ درصد داشته است. همچنین این مدل با دقت بالایی قادر به شناسایی صحیح خانواده های ویروسی در ۲۰۰ نمونه آزمایشی بوده است.

نویسندگان

رضا غفاری

دانشگاه علوم پزشکی ایران

زینب برزگر

دانشگاه علوم پزشکی ایران

امین جهانبخشی

دانشگاه علوم پزشکی ایران

سعیده خطیبی راد

دانشگاه صنعتی شریف

مینا لشکر بلوکی

دانشگاه تربیت مدرس