جذب سطحی وانکومایسین روی ریزتیر با کاربرد زیست حسگری بر پایه شبیه سازی دینامیک مولکولی

فرآیند شبیه سازی جذب آنتی بیوتیک وانکومایسین توسط روش دینامیک مولکولی در این مقاله مورد بررسی قرار گرفته است. این فرآیند به تعیین رفتار جذب وانکومایسین به سطح فعال سازی شده یک حسگر زیستی منجر شده است. با توجه به اهمیت کاربرد آنتی بیوتیک ها در فرآیند درمانی آلودگی های میکروبی، در این مقاله، بررسی سازوکار مولکولی وانکومایسین با نگاه شبیه سازی چند مقیاسی به انجام رسیده است. با توجه به سازوکار عملکرد وانکومایسین، چگونگی اتصال یا جذب آن به یک چیدمان تک لایه مولکولی مد نظر قرار گرفته است. فرآیند جذب روی سطح یک حسگر زیستی شبیه سازی شده است. حسگر زیستی مورد نظر از نوع ریزتیر یکسرگیردار بوده که با تکمیل فرآیند جذب، با توجه به تغییر کشش سطحی تغییر شکل پیدا می کند. این تغییر شکل توسط روش های محاسباتی چند مقیاسی برای حالات تجربی متناظر به دست آمده است. برای بررسی دقیق متغییرهای این مساله، مدل های دینامیک مولکولی برای سطح حسگر حین جذب زیستی در حالات خلا و محیط آبی حل شده است. چگونگی بررسی فرآیند جذب در غالب بررسی مقدار پارامتر انرژی متناظر با کشش سطحی با تغییرات فاصله مولکول هدف و سطح جذب بوده است. همچنین در تعیین فواصل چیدمان مولکولی لایه فعال سطح جاذب روی حسگر، الگوریتمی برای انتخاب چیدمان با توجه به کارهای تجربی مورد توجه قرار گرفته است. مقادیر کشش سطحی به دست آمده در محدوده کارهای تجربی به دست آمده است.

کلیدواژه ها:

Molecular Dynamics ، Vancomycin ، Molecular Absorption ، Simulation ، Microcantilever ، دینامیک مولکولی ، وانکومایسین ، جذب مولکولی ، شبیه سازی ، ریزتیر یکسرگیردار