پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی

هدف: EMT فرایندی برگشت­پذیر و ضروری در طول جنین زایی، بهبود زخم و پیشرفت سرطان است. در بسیاری از سرطان ها، EMT می تواند ویژگی­های تهاجمی تومور را افزایش دهد. اخیرا miRNAها به عنوان کلاس جدیدی از RNA های غیر کدکننده­ تنظیم­گر بیان ژن در مراحل پس از ترجمه دخیل در فرایندEMT   شناخته می­شوند. بااین حال، مکانیسم و اثر دقیق miRNAها در فرایند EMT در سلول های سرطانی انسان هنوز به خوبی مشخص نیست. این مطالعه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک پیش بینی کننده miRNAهای تنظیم کننده ژن های اصلی در فرایندEMT ، تلاش می کند نقش miRNAها را در فرایند EMT روشن کند. مواد و روش ها: در این مطالعه، با استفاده از پایگاه های داده­های تحت وب و ابزارهای پیش بینی برهم کنش miRNAها نظیر DIANA، TargetScan و miRSystem، برهم کنشmiRNAهای تنظیم کننده ژن­های N-cadherin ، TWIST۱، ZEB۱، SNAIL و Vimentin به عنوان بیومارکرهای اصلی سلول های مزانشیمی بررسی شد. نتایج: اثرات miRNAهای متفاوت براساس الگوریتم هر پایگاه بر ژن های نامزد بررسی و داده های به دست آمده از پایگاه های مختلف باهم اشتراک گرفته شد. نتایج نشان داد که یازده miRNA با احتمال بالا به طورمشترک می­توانند در فرایند EMT/MET نقش داشته باشند. نتیجه گیری: براساس یافته های ما، می­توان پیش بینی کرد که با توجه به نمره بالاmiRNA های انتخاب شده با ژن های نامزد، این miRNAها می­توانند نقشی مهم در فرایند EMT/MET داشته باشد. ازاین رو، می توان از آنها به عنوان کاندیدهای مناسب برای تحقیقات بالینی آینده استفاده کرد.   کلمات کلیدی: EMT،MET ، TargetScan، miRSystem، microRNA

کلیدواژه ها:

microRNA ، miRSystem ، TargetScan ، EMT ، MET ، EMT ، MET ، TargetScan ، miRSystem ، microRNA