بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین پیرووات دهیدروژناز زیرواحد بتا در باکتری Mycoplasma agalactiae به منظور توسعه روشهای تشخیصی بر پایه اپی توپ

هدف مطالعه حاضر، بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین پیرووات دهیدروژناز (PDHB) باکتری Mycoplasma agalactiae و تخمین ساختار دوم، نواحی آنتی ژنی و اپی توپهای احتمالی به منظور ارزیابی پتانسیل کاربرد تشخیصی این پروتئین می باشد. در بررسی ساختار دوم، میزان α helices، extended strand، random coil و β turn به ترتیب %۷۳.۴۵، %۳۳.۱۴، %۷۶.۳۴ و %۱۸.۵ بود که حاکی از استحکام مناسب و پتانسیل بالای PDHB در تشکیل اپی توپ می باشد. همچنین ، با بررسی نواحی آبگریز و آنتی ژنی PDHB و تخمین B-cell اپی توپهای گزارش شده توسط نرمافزارهای متعدد، می توان نتیجه گرفت که PDHB، گزینه مناسبی جهت انجام مطالعات تجربی برای توسعه روشهای تشخیصی سرولوژیکی می باشد.

کلیدواژه ها:

پیرووات دهیدروژناز زیرواحد بتا ، بیوانفورماتیک ، آنتی ژن