مدل سازی الگوی ترنسکریپتوم سلول های اپیتلیال راه هوایی موثر در پیشرفت بیماری انسداد مزمن ریوی

سابقه و هدف: بیماری انسداد مزمن ریوی (COPD) یک بیماری ریوی پیشرونده است که بر سلامت جامعه تاثیر مهمی می گذارد. سلول های اپیتلیال راه هوایی، به عنوان سد دفاعی در برابر تهدیدهای خارجی، نقش مهمی در حفظ سلامت راه هوایی ایفا می کنند. در این مطالعه، با استفاده از مدل سازی داده ترانسکریپتوم، ژن های مرتبط با بیماری COPD در سلول های هوایی اپیتلیال شناسایی شده اند. هدف اصلی این مطالعه، شناسایی خوشه های عملکردی مرتبط با COPD در این سلول ها  می­باشد. مواد و روش ­ها: در این مطالعه، نقش سلول های اپیتلیال در COPD با استفاده از مدل سازی داده ترانسکریپتوم بررسی  شد. نمونه های ترانسکریپتوم از گروه های غیرسیگاری و بیماران در مراحل مختلف بیماری تحلیل شد و با استفاده از روش ترسیم درخت های فراگیر و شبکه تنظیم بیان ژن، خوشه های عملکردی شناسایی شدند. یافته ­ها: در این مطالعه، یک خوشه عملکردی شناسایی شدکه نقش فرآیندهای زیستی سمیت زدایی از سلول ها و رگ زایی را پررنگ تر از سایر فرآیندهای زیستی نشان می دهد. ژن های PLAG۱، CYP۴Z۱، ME۱، MUCL۱ و TLR۵ دارای بالاترین شاخص های مرکزی و ژن های CYP۴Z۱، PLAG۱، SLITRK۶، GLI۳ و CABYR دارای بالاترین درجه در شبکه به دست آمده از خوشه های عملکردی بودند. نتیجه گیری: شناخت بهتر از مکانیسم های زیستی و عوامل موثر در COPD می تواند به توسعه روش های جدید در تشخیص، پیشگیری و درمان این بیماری کمک کند. با ادامه تحقیق ها و آزمایش های بیشتر، می توان نقش سلول های هوایی اپیتلیال در COPD را بهبود داده و به توسعه روش های نوین و کارآمدتر در مقابله با این بیماری کمک نمود.

کلیدواژه ها:

COPD ، epithelial ، gene regulatory network modeling ، transcriptome. ، انسداد مزمن ریوی ، اپیتلیال ، مدل سازی شبکه تنظیمی ، ترنسکریپتوم.