مقایسه تنوع ژنتیکی در دو گونه ی یولاف (Avena sativa و Avena fatua) با استفاده از خصوصیات فنوتیپی، نشانگرهای مولکولی و پارامترهای کروموزومی
محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 11، شماره: 1
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 72
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PGRLU-11-1_005
تاریخ نمایه سازی: 13 آذر 1403
چکیده مقاله:
ارزیابی و مقایسه تنوع ژنتیکی در گونه های گیاهی، برای اهداف به نژادی ضروری است. در این مطالعه، تنوع دو گونه ی یولاف زراعی (Avena sativa) و وحشی (Avena fatua) با استفاده از نشانگرهای مولکولی، صفات فنوتیپی و پارامترهای کروموزومی مقایسه شد. با استفاده از نشانگرهای SCoT وIRAP به ترتیب ۲۸۳ و ۱۱۷ نوار تشکیل شد. نشانگرهای SCoT چندشکلی بیشتری را در گونه ی وحشی (۳۷/۶۵ درصد) در مقایسه با گونه ی زراعی (۶۰.۰۷ درصد) نشان دادند. نشانگرهایIRAP نیز به ترتیب با ۷۶.۰۷ و ۶۹.۲۳ درصد چندشکلی، روند مشابهی داشتند. بر اساس شاخص های تنوع ژنتیکی Ne، He و PIC نیز تنوع ژنتیکی نسبتا بیشتری در گونه ی وحشی نسبت به گونه ی زراعی برای هر دو سیستم نشانگری برآورد شد؛ اما فاصله ژنتیکی نسبتا کمتری بین دو گونه وجود داشت. تجزیه ی ساختار جمعیت، با استفاده از روش های بیزین، تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) و تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA)، زیرجمعیت های متمایز و تنوع ژنتیکی قابل توجهی را در درون گونه ها نشان داد و نتایج هر سه روش همسو بودند. بین ژنوتیپ های یولاف از نظر صفات فنوتیپی تفاوت معنی داری وجود داشت. ارتفاع بوته و وزن صددانه به ترتیب در ژنوتیپ های زراعی و در ژنوتیپ های وحشی بیشتر بودند. بر اساس، نقشه حرارتی مبتنی بر صفات فنوتیپی اندازه گیری شده، ژنوتیپ ها در سه دسته گروه بندی شدند. همه ی ژنوتیپ های یولاف هگزاپلوئید بودند؛ اما از نظر پارامترهای کروموزومی نظیر طول کل کروموزوم ها، شاخص سانترومری و شاخص پراکندگی تفاوت هایی داشتند. با این وجود، تفاوت معنی داری بین گونه های زراعی و وحشی از نظر پارامترهای کروموزومی وجود نداشت. تجزیه به مولفه های اصلی (PCA) بر اساس پارامترهای کروموزومی، ۷۲/۹۴ درصد از واریانس تجمعی را تبیین کرد. در این تجزیه، مولفه های اول و دوم به ترتیب بیانگر موقعیت سانترومر و عدم تقارن بین کروموزومی بودند. نتایج این مطالعه، می تواند در برنامه های به نژادی یولاف و راهبردهای حفاظت گونه ها سودمند باشد.
کلیدواژه ها:
Population Structure ، Principal component analysis ، Molecular variance analysis ، Heatmap ، IRAP ، SCoT ، تجزیه به مولفه های اصلی ، تجزیه واریانس مولکولی ، ساختار جمعیت ، نقشه حرارتی ، IRAP ، SCoT
نویسندگان
پرستو زارعی
University of Kurdistan
هدیه بدخشان
Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, University of Kurdistan, Kurdistan, Iran
قادر میرزاقادری
Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, University of Kurdistan, Kurdistan, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :