بررسی جامع ژن ها و eRNA های درگیر در سرطان معده و ساخت مدل پیش آگهی برای بقای کلی بیماران
محل انتشار: مجله دانشکده پزشکی اصفهان، دوره: 41، شماره: 724
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 28
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IMSJ-41-724_002
تاریخ نمایه سازی: 13 آبان 1403
چکیده مقاله:
مقاله پژوهشیمقدمه: سرطان معده، یکی از شایع ترین سرطان ها و اولین علت مرگ ناشی از سرطان ها در ایران است. به دلیل دانش ناکافی در مورد عناصر مولکولی دخیل در بیماری برای معرفی زیست نشانگرهای تشخیصی/ پیش آگهی دهنده، بیماران مبتلا در مراحل بالاتر تشخیص داده می شوند که این امر منجر به پیش آگهی ضعیف این بیماران می شود. هدف مطالعه ی حاضر، بررسی جامع enhancer RNAs (eRNAs) به منظور تعیین ارتباطات مولکولی این عناصر با سایر ژن ها و ساخت یک مدل مرتبط با بقای بیماران بود.روش ها: اطلاعات خام توالی یابی رونوشت ها در نمونه های سرطان معده از پایگاه داده ی اطلس ژنوم سرطان اخذ و eRNAها و ژن های با بیان متمایز در نمونه های توموری نسبت به نمونه های غیرتوموری استخراج شد. سپس ژن های هدف eRNAهای با بیان متمایز بر اساس فاصله ی فیزیکی و همبستگی تعیین شدند و شبکه ی تنظیمی با استفاده از این عناصر ترسیم شد. در نهایت با انجام تحلیل رگرسیون کاکس تک متغیره و چندمتغیره، یک مدل پیش آگهی دهنده برای پیش بینی بقای کلی بیماران ساخته و کارآیی مدل بررسی شد.یافته ها: با انجام تحلیل تمایز بیانی، ۶۹ eRNA و ۲۶۰۶ ژن دارای بیان متمایز استخراج شدند و با تعیین ارتباطات بین آن ها، یک شبکه ی تنظیمی متشکل از ۸۴ گره و ۱۱۹ یال ترسیم شد. در نهایت یک مدل سه جزئی مرتبط با بقا ساخته شد که قادر به پیش بینی بقای بیماران بود.نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد، مدل سه جزئی ساخته شده شامل یک eRNA و دو ژن دیگر می تواند به عنوان ابزار پیش آگهی دهنده در سرطان معده مورد استفاده قرار گیرد؛ اگرچه مطالعات گسترده تری برای کاربرد بالینی این مدل لازم است.
کلیدواژه ها:
رونوشت های نسخه برداری شده از افزاینده ها ، سرطان های معده ، تحلیل بقاء ، زیست شناسی سامانه ای ، توالی یابی RNA
نویسندگان
بصیره بهرامی
کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران
پروانه نیک پور
دانشیار، گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
