بهینه کردن کیفی و کمی محصول واکنش زنجیره ای پلیمراز ژن FOXE۱ به عنوان ژنی غنی از GC

مقاله پژوهشیمقدمه: تقریبا ۳ درصد از ژنوم انسان غنی از GC است. این نواحی اغلب در پروموتر ژن ها، به ویژه ژن های خانه دار و ژن های سرکوب گر تومور یافت می شوند. تکثیر این مناطق غنی از GC می تواند چالش برانگیز باشد. زیرا پایداری توالی DNA غنی از GC بیشتر بوده، همچنین ساختارهای ثانویه به آسانی در این مناطق تشکیل می شوند. ژن FOXE۱ به خانواده بزرگی از فاکتورهای رونویسی تعلق دارد که برای مورفوژنز غده ی تیروئید ضروری می باشد و به عنوان فاکتور مستعد کننده در سرطان تیروئید غیر مدولاری نوع ۴ معرفی شده است.روش ها: مطالعه ی حاضر از نوع تجربی است که به نحوه ی تکثیر قسمتی از توالی ژن FOXE۱ با درصد بالای GC که با واکنش زنجیره ای پلیمراز معمولی قابل انجام نمی باشد پرداخته است.یافته ها: نتایج این مطالعه نشان داد، استفاده از مواد تقویت کننده ی تکثیر مناطق غنی از GC، نظیر بتائین ودی متیل سولفوکسید (DMSO) به همراه واکنش زنجیره ای پلیمراز از نوع Touchdown در تکثیر توالی این ناحیه از ژن FOXE۱ با تخریب ساختارهای ثانویه تشکیل شده در توالی و افزایش محصول واکنش موثر می باشد.نتیجه گیری: این روش می تواند برای تکثیر نواحی غنی از GC در ژن های دیگر، که درصد مشابهی از GC با ژن FOXE۱ دارند به کار گرفته شود.

کلیدواژه ها:

توالی غنی از GC ، FOXE۱ ، بتائین ، DMSO ، Touchdown PCR