استفاده از نشانگر مولکولی PCR-RFLP در شناسایی بیووارهای باکتری مولدپژمردگی باکتریایی سیب زمینی

بیماری پژمردگی باکتریایی سیب زمینی که در اثر باکتری Ralstonia solanacearum به وجود می آید باعث آلوده شدن سیب زمینی در تمامی نواحی مناطق معتدله گرم و نیمه گرمسیری دنیا شده است. اختلافات فنوتیپی و ژنوتیپی زیادی در گونه R .solanacearam وجود دارد که ممکن است ناشی از تنوع زیاد میزبان های گیاهی این پاتوژن باشد. این میزبان ها در دامنه ی وسیع جغرافیایی و شرایط محیطی گوناگون قرار گرفته اند. براساس دامنه میزبانی، این گونه را به نژادهای مختلفی تقسیم بندی می کنند. اختلاف در فعالیت های متابولیسمی نیز باعث تقسیم بندی این گونه به بیووارهای مختلفی می شود. از ارقام مختلف سیب زمینی جمع آوری شده از مناطق عمده سیب زمینی کاری استان کرمان شامل جیرفت، ساردوئیه، لاله زار و صوغان تعدادی جدایه از باکتری R.solanacearum جدا سازی شد. بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و توانایی جدایه ها در استفاده از قندهای مختلف نشان داد که این جدایه ها مربوط به بیووار ۲ باکتری هستند. برای تعیین بیوتیپ های بیووار ۲ از قندهای مزواینوزیتول، ترهالوز و دی ریبوز استفاده شد. PCR-RFLP محصول PCR حاصل از جفت آغازگر اختصاصی(P(۷۵۹ و (P(۷۶۰ با آنزیم برشی HaeIII تعداد دو نوار دی. ان. ای. نشان داد، در حالی که چهار نوار دی.ان.ای. به وسیله ی آنزیم برشی MspI به دست آمد که این شکل از نوارهای ایجاد شده در اثر دو آنزیم برشی مذکور مربوط به بیووار ۲ نژاد۳ باکتری R. solanacearum می باشد و نژادها و بیووارهای دیگر چنین الگویی ایجاد نمی کنند.

کلیدواژه ها:

پژمردگی باکتریایی سیب زمینی ، PCR-RFLP ، بیووار ، Ralstonia solanacearum