ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

کاوش ژنومی نشانه های انتخاب جهت شناسایی مکان های کروموزومی مرتبط با بیماری یون در گاوهای هلشتاین

محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 55، شماره: 3
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 169

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2093876

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-55-3_003

تاریخ نمایه سازی: 15 مهر 1403

چکیده مقاله:

انتخاب باعث ایجاد نشانه­های انتخاب در سطح ژنوم می­­شود. شناسایی نشانه­های انتخاب در حیوانات در جهت ارتقا صفات اقتصادی و کاهش بیماریها، یکی از اصلی­ترین و چالش برانگیزترین تحقیقات در زمینه ژنتیک جمعیت است. در این تحقیق، با هدف شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت بین جمعیت­های گاوهای مبتلا به بیماری یون و سالم هلشتاین، پویش گستره ژنوم با استفاده از چندشکلی­های تک نوکلئوتیدی (SNP) انجام شد. این تحقیق بر روی گاو­های گاوداری فوکا در اصفهان بر روی ۱۴۵ راس گاو هلشتاین انجام شد. بر اساس تراشه های ۳۰K شرکت ایلومینا تعیین ژنوتیپ و گاو­ها به دو گروه بیمار و سالم گروه بندی شدند. گروه بیمار شامل ۴۵ راس و گروه سالم شامل ۱۰۰ راس گاو بود. در این مطالعه برای شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب از دو آماره FST و XP-EHH استفاده شد. ژن­های شناسایی شده توسط آماره FST در دو جمعیت بیمار و سالم شاملRAB۳۷, ZC۳H۱۰, ESR۱ HSD۱۷B۶, KCNC۴, ERBB۳ و NACA بودند. ژن­های شناسایی شده توسط آماره XP-EHH در دو جمعیت بیمار و سالم شاملAK۱, ATP۸A۱, BTBD۱, C۱GALT۱, CCDC۶, CEP۲۹۵, CLGN, CLSTN۲, EHHADH,  ERBB۴, FRK, GRID۲, GRIP۱ و LRP۶  بودند. اکثر ژن های شناسایی شده در این مطالعه با ایمنی، بیماری هایی مثل سرطان، شیردهی، ماهیچه های اسکلتی، چرخه فحلی، مصرف خوراک، چسبندگی اسپرم و رشد در ارتباط بود، که جزو صفات و ویژگی های مهم زیستی جاندار قرار می گیرد. مطمئنا مطالعات گسترده­تر با تعداد نمونه­های بیشتر، درک بهتری از ژن­های کاندید برای بیماری یون در گاو و طراحی برنامه­های اصلاح نژادی موفق در جهت کاهش هزینه­های ناشی از بیماری، ایجاد خواهد نمود.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

فاطمه ناوشکی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران:

حسین مرادی شهربابک

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران

علی صادقی سفید مزگی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران:

جوهان سولکنر

. گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه بوکو، وینا، اتریش

مهدی جوان نیکخواه

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Amiri, M., Conserva, F., Panayiotou, C., Karlsson, A., & Solaroli, ...
  • Berger, F., Berkholz, J., Breustedt, T., Ploen, D., & Munz, ...
  • Bertolini, F., Moscatelli, G., Schiavo, G., Bovo, S., Ribani, A., ...
  • Bindea, G., Mlecnik, B., Hackl, H., Charoentong, P., Tosolini, M., ...
  • Breitenkamp, A. F., Matthes, J., Nass, R. D., Sinzig, J., ...
  • Chang, C. W., Hsu, W. B., Tsai, J. J., Tang, ...
  • Chiodini, R. J., Van Kruiningen, H. J., & Merkal, R. ...
  • Choi, J., Young, J. A., & Callaway, E. M. (۲۰۱۰). ...
  • Clarke, C. J. (۱۹۹۷). The pathology and pathogenesis of paratuberculosis ...
  • Du, C., Deng, T. X., Zhou, Y., Ghanem, N., & ...
  • Elegheert, J., Kakegawa, W., Clay, J. E., Shanks, N. F., ...
  • Fang, H., Ao, S., Yun, L., Jianbo, L., Haobang, L., ...
  • Ferreira, M. A., O'Donovan, M. C., Meng, Y. A., Jones, ...
  • Fortes, M. R. S., Reverter, A., Kelly, M., McCulloch, R., ...
  • Furukawa, M., He, Y. J., Borchers, C., & Xiong, Y. ...
  • Gaudet, P., Livstone, M. S., Lewis, S. E., & Thomas, ...
  • Ghanshani, S., Pak, M., McPherson, J. D., Strong, M., Dethlefs, ...
  • Grasa, P., Ploutarchou, P., & Williams, S. A. (۲۰۱۵). Oocytes ...
  • Gyles, C.L. and Theon, O.C. (۱۹۹۳). Pathogenesis of Bacterial Infection ...
  • Hayes, B. J., Chamberlain, A. J., Maceachern, S., Savin, K., ...
  • Houten, S. M., Denis, S., Argmann, C. A., Jia, Y., ...
  • Huang, X. F. (۲۰۰۰). Molecular characterization of a first human ...
  • Ikawa, M., Nakanishi, T., Yamada, S., Wada, I., Kominami, K., ...
  • Izquierdo, D., Wang, W. J., Uryu, K., & Tsou, M. ...
  • Jeyabalan, N., & Clement, J. P. (۲۰۱۶). SYNGAP۱: mind the ...
  • Jia, Z., Chen, A., Wang, C., He, M., Xu, J., ...
  • Jones, T. C., Hunt, R. D., & King, N. W. ...
  • Kato, M., Takaishi, H., Yoda, M., Tohmonda, T., Takito, J., ...
  • Kennedy, D. J., & Benedictus, G. (۲۰۰۱). Control of Mycobacterium ...
  • Li, G., Yang, R., Lu, X., Liu, Y., He, W., ...
  • Liu, C. C., Tsai, C. W., Deak, F., Rogers, J., ...
  • Liu, C. H., Hu, R. H., Huang, M. J., Lai, ...
  • Marín-Garzón, N. A., Magalhães, A. F. B., Schmidt, P. I., ...
  • Mas, S., Gassó, P., Bernardo, M., & Lafuente, A. (۲۰۱۳). ...
  • Matsuura, S., Igarashi, M., Tanizawa, Y., Yamada, M., Kishi, F., ...
  • McPhaul, M. J., Marcelli, M., Zoppi, S., Griffin, J. E., ...
  • Molli, P. R., Singh, R. R., Lee, S. W., & ...
  • Morra, F., Luise, C., Merolla, F., Poser, I., Visconti, R., ...
  • Qi, C., Zhu, Y., Pan, J., Usuda, N., Maeda, N., ...
  • Sá Filho, M. F. D., Gonella-Diaza, A. M., Sponchiado, M., ...
  • Sabeti, P. C., Varilly, P., Fry, B., Lohmueller, J., Hostetter, ...
  • Saito, R., Smoot, M. E., Ono, K., Ruscheinski, J., Wang, ...
  • Santana, M. H. A., Kadarmideen, H., Pant, S., Alexandre, P., ...
  • Santana, M. H. D. A., Ventura, R. V., Utsunomiya, Y. ...
  • Schlötterer, C. (۲۰۰۳). Hitchhiking mapping–functional genomics from the population genetics ...
  • Shaw, C. A., Li, Y., Wiszniewska, J., Chasse, S., Zaidi, ...
  • Sherman, E. L., Nkrumah, J. D., & Moore, S. S. ...
  • Smith, R. L., Strawderman, R. L., Schukken, Y. H., Wells, ...
  • Tidcombe, H., Jackson-Fisher, A., Mathers, K., Stern, D. F., Gassmann, ...
  • Utsunomiya, Y. T., Pérez O'Brien, A. M., Sonstegard, T. S., ...
  • Van der Giessen, J. W. B., Eger, A., Haagsma, J., ...
  • Wang, L., Gao, Y., Wang, J., Huang, N., Jiang, Q., ...
  • Weir, B. S., & Cockerham, C. C. (۱۹۸۴). Estimating F-statistics ...
  • Zhang, H., Shen, L. Y., Xu, Z. C., Kramer, L. ...
  • Zhang, X., Dong, W., Zhou, H., Li, H., Wang, N., ...
    • نمایش کامل مراجع