طراحی بیوانفورماتیکی یک پروتئین چنداپیتوپی جدید جهت کاربرد در توسعه روش تشخیص باکتریMycoplasma agalactiae

با پیشرفت ابزارهای بیوانفورماتیکی در تحلیل و آنالیز ماکرومولکول ها و همچنین دسترسی به ژنوم کامل باکتریMycoplasma agalactiae امکان طراحی سازههای جدید جهت استفاده در روش های تشخیص و تولید واکسن علیه اینباکتری فراهم گردیده است. در این مطالعه با استفاده از ابزارهای متعدد بیوانفورماتیکی، یک پروتئین چنداپیتوپی کاربردیدر توسعه روش تشخیص آلودگی ناشی از باکتری Mycoplasma agalactiae طراحی و جهت انجام مراحل تجربی پیشنهادگردید. بدین منظور، با استفاده از سرورهای آنلاین مختلف، ORF های مربوط به کل پروتئین های membrane Outer وExteracellular باکتری که در معرض سیستم ایمنی میزبان می باشند تعیین گردید. پس از انجام آنالیزهای متعدد،اپیتوپ های llce-B که غیرتوکسیک، غیرآلرژن، دارای اختصاصیت برای باکتری و با قدرت آنتیژنی بالا بودند انتخاب شدهو با استفاده از لینکر KK به هم متصل شدند. پروتئین چنداپیتوپی حاصل، از نظر خصوصیات فیزیکوشیمیایی، ساختار دومو برهمکنش با سلول های ایمنی میزبان مورد بررسی قرار گرفت. از یافته های این مطالعه میتوان نتیجه گرفت که پروتئینچنداپیتوپی طراحی شده ی حاصل، پایدار، دارای خاصیت آنتی ژنی بالا، قادر به برهمکنش مطلوب با سلول های ایمنی بدنمیزبان بوده و جهت سنتز و انجام مطالعات تجربی مناسب می باشد

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، اپیتوپ ، آنتیژن ، Mycoplasma agalactiae ، تست تشخیصی