تعیین مکان نواحی کدکننده پروتئین درتوالی DNA با استفاده ازالگوریتم ترکیبی تبدیل موجک گسسته و فیلترهای تطبیقی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 864

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICEE21_324

تاریخ نمایه سازی: 27 مرداد 1392

چکیده مقاله:

شناسایی دقیق نواحی کدکننده پروتئین درژن ها با استفاده ازابزارهای پردازش سیگنال درسالهای اخیر به چالشی دربیوانفورماتیک تبدیل شده است بسیاری ازروشها پردازش سیگنالهای ژنومیک برمبنای خاصیت تناوب -3 بازهای موجود دررشته های DNA متمرکز بوده و سپس تحلیلهای طیفی به منظور یافتن موقعیت مولفه های متناوب برروی توالی های عددی DNA اعمال میشود دراین مقاله با استفاده از روشت رکیبی تبدیل موجک گسسته و فیلترهای تطبیقی الگوریتمی به منظور تعیین نواحی کدکننده پروتئین ارایه می کنیم ازتبدیل موجک گسسته به منظور حذف نویز فرکانس بالا و بهبود دقت درتخمین استفاده میکنیم همچنین به منظور استخراج مولفه تناوب 3- و تعیین نواحی ژنی درتوالی DNA ازالگوریتم تطبیقی کمترین مربعات برگشتی استفاده می نماییم الگوریتم پیشنهادی برروی ژنهای مختلف ازجمله ژنهای موجود درپایگاه های داده BG570 ی HMR195 اعمال و نتایج آن با سایرروشهای موجود مقایسه شده است نتایج شبیه سازی نشان میدهد که الگوریتم پیشنهادی ازعملکرد بسیارخوبی درتعیین نواحی کدکننده پروتئین و خصوصا درتعیین ژنی با ابعاد کوچک برخوردار است

نویسندگان

حمیدرضا صابرکاری

دانشگاه صنعتی سهند تبریز ایران