بررسی تنوع ژنتیکی کاکوتی (Ziziphora tenuior L) با استفاده از نشانگر SCoT
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 150
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJRFP-24-2_002
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403
چکیده مقاله:
در این مطالعه از ۲۵ آغازگر SCoT برای مطالعه تنوع ژنتیکی ۴۲ نمونه کاکوتی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران استفاده شد. در مجموع ۲۰۹ قطعه تکثیر شد و ۶۶% از آنها چندشکل بودند. بیشترین قطعات تکثیر شده چند شکل (۱۰) مربوط به آغازگر SCoT-۵۴ بود، و همچنین کمترین تعداد قطعات چندشکل (۲) مربوط به آغازگر SCoT-۲۰ بود. متوسط تعداد باند برای هر آغازگر ۳۶/۸ و متوسط باندهای چندشکل ۵۳/۵ بود. محتوای اطلاعات چندشکلی و قدرت تفکیک (PICD) بین ۲۱۷/۰ در آغازگر SCoT-۳۱ و ۰۷/۰ در آغازگر SCoT-۳۰ با میانگین ۱۵۶/۰ متغیر بود. ماتریس تشابه با استفاده از ضریب جاکارد، تجزیه خوشه ای با الگوریتم UPGMA و تجزیه به مختصات اصلی انجام شد. براساس تجزیه خوشه ای، در ضریب تشابه ۷/۰ نمونه های کاکوتی به ۷ گروه تقسیم شدند. براساس ماتریس تشابه، کمترین شباهت (۵۹/۰) مربوط به دو نمونه نائین و یاسوج، و همچنین بیشترین شباهت (۹۸/۰) بین دو نمونه از دامغان و گرمسار از یک منطقه جغرافیایی مشابه بود. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) حکایت از تنوع زیاد در داخل نمونه ها داشت. در واقع ۸۹% از واریانس در داخل نمونه ها و ۱۱% از واریانس در بین نمونه های کاکوتی بود. در نهایت نتایج نشان دهنده تنوع مناسب در بین ژنوتیپ های مورد مطالعه بود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Navid Zamani
مربی، دانشکده محیط زیست و منابع طبیعی، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیا، بهبهان
Vahid Zamani
مربی، دانشگاه ژوزف فوریر، دانشکده اکولوژی آلپین، گرونوبل، فرانسه
Khaled Mirzaei
کارشناس ارشد، دانشگاه کردستان، سنندج
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
