ردیابی و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus) از درختان گیلاس استان خراسان رضوی

ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus, PDV) به عنوان یک عامل بیماری زا مهم در درختان گیلاس (Prunus avium L.)، شناخته شده است و خسارت جدی به درختان هسته دار می رساند. در بهار سال ۱۴۰۱ نمونه برداری از مجموعه درختان باغ گیلاس ایستگاه تحقیقات گلمکان مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی، انجام شد. نمونه های جمع آوری شده دارای علائم کوتولگی، میوه های لکه دار، کاهش رشد جوانه ها بودند و فاصله ی میانگره های شاخه نسبت به گیاهان سالم کمتر بود. برای ردیابی ویروس از آزمون رونویسی معکوس با پرایمرهای اختصاصی مبتنی بر ژن پروتئین حرکتی ویروس استفاده شد. قطعات ۷۵۶ نوکلئوتیدی حاصل از الکتروفورز تکثیر شده پس از خالص سازی، ایزوله گلمکان توالی یابی شد. ترادف به دست آمده با استفاده از بلاست در پایگاه NCBI با ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه شد و بیشترین شباهت با جدایه بلغارستان (%۷/۹۹MT۱۵۲۱۷۶, ) و کمترین شباهت با جدایه هلند (%۸/۸۸HM۰۲۱۲۳۱, ) مشاهده شد. درخت تبارزائی بر پایه پروتئین حرکتی ترسیم شد و جدایه های PDV در دو گروه مجزا قرار گرفتند و جدایه گلمکان در گروه I درخت فیلوژنتیک قرار گرفت. مقایسه توالی پروتئین حرکتی جدایه های ویروس نشان داد توالی های اسیدآمینه پروتئین حرکتی و دامنه اتصال به RNA پروتئین حرکتی در میان ویروس کوتولگی گوجه بسیار حفاظت شده است. در این پژوهش برای اولین بار توالی ویروس کوتولگی گوجه از ایران از باغ گیلاس در ژن بانک با رس شماره OR۵۴۱۱۰۶ ثبت شد و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه با تمرکز بر ژن پروتئین حرکتی بررسی شد.

کلیدواژه ها:

Movement protein ، Prunus spp. ، Phylogenetic tree. ، پروتئین حرکتی ، تحلیل تبارزائی ، درختان هسته دار ، درخت فیلوژنتیک