بررسی پروتئین p5cs در چند گیاه مختلف با استفاده از ابزار بیو انفورماتیکی

یکی از پاسخ های عمومی سلول های گیاهی به فشارهای اسمزی ، تجمع متابولیتهای مانند پرولین است که دلیل افزایش پرولین در سلول به دلیل القا فعالیت انزیمهای دلتا- 1- پرولین 5-کربوکسیلات سنتار P5CS و پرولین 5-کربوکسیلات ردوکتاز P5CR که انزیم های کلیدی در چرخه تولید این ماده در سلول به شمار میروند.هدف اصلی از این مطالعه بررسی خصوصیات آنزیم P5CS در چند گیاه مختلف با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی است. نتایج حاصل از رسم فیلوژنی این توالی ها نشان داد که این توالی ها به 5 کلاس طبقه بندی میشوند به طوری که Manihot esculenta و Ricinus communis در یک Ricinus communis در یک گروه و تولی های مربوط به گیاهان arabidopsis lytera ،Linum usitatissimum ،Prunus persica و Populus trichocarpa در گروهای مجزا ازهم قرار میگیرند. کمترین و بیشترین طول مربوط به Prunus persica با 717 و Manihot esculenta با 739 اسید امینه بود. بیشترین و کمترین وزن ملکولی به ترتیب مربوط به Prunus persica با 77 و Manihot esculenta با 739 کیلودالتون بود Linum usitatissimum بیشترین شاخص الیفاتیک را در میان توالی ها سایر گیاهان داشت.محتوای ریشه هیدروفوبیک، محتوای ریشه هیدروفیلیک ، محتوای بار منفی ریشه و محتوای بار مثبت ریشه در این توالی های مورد بررسی در محدود 0.5 ، 0.22 ، 0.22 و 0.11 بود که بیشترین و کمترین مارپیچ الفا به ترتیب مربوط به arabidopsis lytera و Linum usitatissimum بود همچنین بیشترین و کمترین صفحات بتا مربوط به Linum usitatissimum و Manihot esculenta ب ود. همه توالی ها دارای دو دومین اصلی AAK و ALDH-SF میباشند.

کلیدواژه ها:

p5cs ، بیو انفورماتیک