ارزیابی روش های SS-GBLUP ،Boosting و SS-BayesA: با در نظر گرفتن ایمپیوتیشن داده های ژنومی
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: دومین کنگره دانشجویان کشاورزی، دامپزشکی، محیط زیست و منابع طبیعی
- کد COI اختصاصی: CACDSTS02_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 159
نویسندگان
دانشیار، گروه علوم دامی، واحد آستارا، دانشگاه آزاد اسلامی، آستارا، ایران
چکیده
هدف از تحقیق حاضر، بررسی نقش روابط خویشاونددی ژنومی بین جمعیت مرجع و تایید و معماری های مختلف ژنومی بر عملکرد روش های بوستینگ و تک مرحله ای بیز A و GBLUP با در نظر گرفتن ایمپیوتیشن (Imputation) داده های ژنومی شبیه سازی شده بود. بدین منظور، جمعیت های ژنومی برای سطوح مختلف تعداد جایگاه های صفات کمی (۱۰، ۱۰۰ و ۱۰۰۰) بر روی ۲۹ کروموزم شبیه سازی شدند. برای شبیه سازی شرایط واقعی ، بطور تصادفی اقدام به حذف (۷۰درصد) برخی نشانگرها نموده و در مرحله بعد از طریق نرم افزار Flmpute اقدام به ایمپیوتیشن و پیش بینی نقاط گم شده نموده و صحت ایمپیوتیشن مورد ارزیابی قرار گرفت. در نهایت داده های اصلی و ایمپیوتیشن با استفاده از روش های بوستینگ و تک مرحله ای بیز A و تک مرحله ای GBLUP جهت پیش بینی ارزش های اصلاحی ژنومی طی نسل های G۱ و G۳ مورد ارزیابی قرار گرفتند. در مقایسه با روش های تک مرحله ای بیز A و بوستینگ، روش تک مرحله ای GBLUP عملکرد بالاتری در تعداد بالای QTL نشان داد.کلیدواژه ها
انتخاب ژنومی، روابط خویشاوندی ژنومی، روش تک مرحله ای، یادگیری ماشینمقالات مرتبط جدید
- A Comprehensive Review of The Challenges Facing the Use of Nanoparticles in The Treatment of Parasitic Infections
- مروری بر لیشمانیوز از اپیدمیولوژی تا روش های تشخیصی نوین
- مروری بر روشهای خشک کردن گیاهان باتاکید بر خشک کردن پاششی
- بهبود فرایندهای تشخیصی و پیشگیری سرطان حیوانات با هوش مصنوعی و فناوری های نوین: پیشرفت ها، چالش ها و چشم انداز آینده
- Integrated Interdisciplinary One Health Surveillance Systems for Early Detection of Disease Spillovers: Pandemic Preparedness and Outbreak Investigation
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.