بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر فاکتور نورون زایی مشتق شده از مغز بر میزان بیان ژن در رده سلولی SH-SY۵Y

مقدمه: با توجه به اهمیت بررسی و شناسایی مسیرهای حفاظتی BDNF، تحقیق اخیر با استفاده از پایگاه های داده بیوانفورماتیکی با هدف آنالیز میزان بیان ژن های ثبت شده در پایگاه داده NCBI به منظور شناخت ژن های بیان شده در رده سلولی SH-SY۵Y در نتیجه تیمار با BDNF و استرس اکسیداتیو و شناسایی مسیر های حفاظتی BDNF انجام شد. روش: در مطالعه حاضر با استفاده از سرورهای بیوانفورماتیکی و پایگاه داده NCBI و با جستجوی کتابخانه هایی حاوی بیش از ۴۸۰۰۰ واحد داده حاصل از تجزیه  و تحلیل نرم افزار Illumina و Bid studio با نمونه برداری دستی در مرحله نخست (بر اساس P -value) و در مرحله دوم بر اساس میزان ارتباط با سازگاری نورون توسط نرم افزار SPSS  نسخه ۲۰ میزان همبستگی پیرسون و همبستگی اسپیرمن و رابطه خطی با سنجش میزان برازش یا رگرسیون اندازه گیری و آنالیزها انجام شد. نتایج: همبستگی پیرسون بین داده های CTR و CMP مثبت و رابطه خطی بین آن ها با اندازه گیری رگرسیون مثبت تایید گردید. بر اساس نتایج به دست آمده، درصد پروتئین های سازگار کننده نورون از داده های CTR نسبت به داده های CMP بیشتر بود. بیشترین پروتئین های حفاظت نورون مربوط به حفظ شکل سلول و اسکلت سلولی و مرتبط با بقای نورون بودند. نتیجه گیری: در نتیجه تماس نورون ها با BDNF، برخی از ژن ها به صورت اختصاصی بیان شدند؛ بنابراین این عامل می تواند سبب افزایش طول عمر و سازگاری بیشتر نورون ها باشد.

کلیدواژه ها:

Neuron ، Brain-derived neurogenic factor ، SH-SY۵Y ، NCBI ، نورون ، فاکتور نورون زایی مشتق شده از مغز ، SH-SY۵Y ، NCBI