ارزیابی بیوانفورماتیک و سیگنالی مجموع mRNA هدف و عملکرد SNP مرتبط با آن در افراد مبتلا به سرطان معده

مقدمه: سرطان معده در جهان به عنوان چهارمین سرطان شایع و دومین عامل مرگ بر اثر سرطان شناخته می شود. که علاوه بر هزینه های قابل توجه، مشکلات عدیده ای را بر خانواده ها تحمیل نموده که خود توجیه مناسبی جهت شناسایی بیومارکرهای مرتبط می باشد. روش: برای یافتن اطلاعات بیوانفورماتیکی از وبسایت miRBASE  استفاده شد. همچنین پایگاه های داده  mirWALK و miRNASN برای یافتن اطلاعات مربوط به miRNA ها جستجو شدند . برای یافتن مسیر سرطانی از پایگاه های داده DAVID database و Kegg استفاده شد.  نتایج: مطالعات انجام شده در اولین مسیر، میکرو RNA، has-miR-۱۰a-۳p، با اتصال به rs۱۰۴۹۲۱۶ در ژن CASP۳،  با اعمال اثر مهاری بر این ژن، از ایجاد سرطان جلوگیری می نماید. در دومین مسیر، میکرو RNA، has-miR-۲۹۶-۳p، با اتصال به rs۱۵۶۴۴۸۳ در ژن BCL۲، با اعمال اثر مهاری بر این ژن، باعث ایجاد سرطان می شود. در سومین مسیر، میکرو RNA، has-miR-۱۹۴-۳p، با اتصال به rs۷۱۷۷ در ژن CCND۱، با اعمال اثر مهاری بر این ژن، از ایجاد سرطان جلوگیری می نماید. نتیجه گیری: در این پژوهش مسیرهای سرطانی ای پیش بینی شد که دخیل در سرطان معده هستند،  با یافتن سه SNP بر روی مناطق خاصی از این سه ژن، دریافتیم که این SNPها می توانند عامل ایجاد سرطان معده باشند و می توانند به عنوان بیومارکرهای زیستی معرفی و به کار روند.

کلیدواژه ها:

Bioinformatics ، micro RNA ، Gastric Cancer ، SNP ، Targeted Medicine ، Helicobacter pylori ، بیوانفورماتیک ، میکرو RNA ، سرطان معده ، SNP ، درمان هدفمند ، هلیکوباکترپیلوری