بررسی مسیرهای سیگنالی دخیل در تقابل عفونت ویروس های فرصت طلب با سلول های لنفوسیت T کمکی

مقدمه: افرادی که سیستم ایمنی ضعیفی دارند سریع تر به عفونت های فرصت طلب (OIs) مبتلا  می شوند. یافتن ارتباط ویروس ها و مسیر های سیگنالی مرتبط با عفونت های این ویروس ها مثل اپشتین بار ویروس (EBV ) و سایتو مگالو ویروس ( CMV ) نقش قابل ملاحظه ای در بررسی ارتباط آن ها با سلول های لنفوسیت T کمکی دارند. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن های موجود در مسیرهای وابسته به عفونت ویروس های فرصت طلب با سلول های لنفوسیت  T کمکی پرداخته شد. روش: در این مطالعه با مراجعه به پایگاه داده GEO دیتاست مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در عفونت ویروس های EBV و  CMVبود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته بندی شدند. برای ارزیابی دقیق تر داده از پایگاه های داده غنی همچون Enrichr، STRING و Networkanalyst استفاده شد. در نهایت ژن های کاندید شده جدا و ارتباط پروتئینی آن ها نیز سنجیده شد. نتایج: ۹۶۴ ژن با بیان بالا و ۸۳۷ ژن با بیان پایین در مسیرهای پیشرفت عفونت ویروسی های فرصت طلب با لنفوسیت ها نقش دارند. مسیر های چرخه سلولی، استرس اکسیداتیو، سنتز RNA و TGFB به صورت بارزی مشاهده شدند. نتیجه گیری: مطالعه حاضر نشان داد که پروتئین ها و ژن های مهمی در تقویت التهاب ویروس های فرصت طلب همچون اپشتین بار و سایتومگالو ویروس نقش عمده ای داشته که از میان آن ها CDK۲, CCNB۱, GSK۳B, SRC و SMAD۳ نقش بارزتری را نشان دادند.

کلیدواژه ها:

Epstein Barr Virus ، Gene Expression Profile ، Bioinformatics Analysis ، Cytomegalovirus ، Opportunistic Viruses ، اپشتین بار ویروس ، پروفایل بیان ژن ، آنالیز بیوانفورماتیک ، سایتو مگالو ویروس ، ویروس های فرصت طلب