Searching the genome of beluga(Husohuso) for sex markers based on targeted Bulked SegregantAnalysis (BSA)

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 30

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CJES-12-2_003

تاریخ نمایه سازی: 21 خرداد 1403

چکیده مقاله:

In sturgeon aquaculture, where the main purpose is caviar production, a reliable method is needed to separate fish according to gender. Currently, due to the lack of external sexual dimorphism, the fish are sexed by an invasive surgical examination of the gonads. Development of a non-invasive procedure for sexing fish based on genetic markers is of special interest. In the present study we employed Bulked SegregantAnalysis (BSA) methodology to search for DNA markers associated with the sex of the beluga sturgeon (Husohuso).DNA bulks (male and female) were created by combining equal amounts of genomic DNA from ۱۰ fish of both sexes. A total of ۱۰۱ decamer primers associated with the sex-specific sequences in non-sturgeon species was used for targeted screening of the bulks, resulting in ۲۸۴۶ bands that all of them were present in both sexes. Our results showed that sex chromosomes are weakly differentiated in the sturgeon genome and comprised  sequences not complementary to the sex-specific primers in non-sturgeon species.

کلیدواژه ها:

Beluga ، Husohuso ، sex marker ، genetics ، bulked segregant analysis (BSA)

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abe H., Kanehara M, Terada T., Ohbayashi F., Shimada T., ...
  • Agrawal V, Sharma K, Gupta S, Kumar R, Prasad M ...
  • Alstrom-Rapaport C., Lascoux M, Wang YC, Roberts G. &Tuskan GA ...
  • Alves-Costa F.A.&Wasko A.P. (۲۰۱۰) Identification of sexually dimorphic gene expression ...
  • Banerjee N.S., Manoj P.& Das M.R. (۱۹۹۹)Male sex associated marker ...
  • Bardakci F. (۲۰۰۰) The Use of Random Amplified Polymorphic DNA ...
  • Bemis W.E., Findies E.K. &Grande L (۱۹۹۷) An overview of ...
  • Billard R, Lecointre G (۲۰۰۰) Biology and conservation of sturgeon ...
  • Birstein V.J.(۱۹۹۳) Sturgeons and Paddlefishes - Threatened Fishes in Need ...
  • Casas, L., Sanchez, L.&Orban, L.,(۲۰۱۱) Sex-associated DNA markers from turbot. ...
  • Cesoniene L., Daubaras R. &Gelvonauskis B. (۲۰۰۷) Evaluation of genetic ...
  • Chapman F.A., Van Eenennaam J.P., Doroshov S.I. (۱۹۹۶)The reproductive condition ...
  • Chen J., Wang Y., Yue Y., Xia X., Du Q. ...
  • da Silva, E. M., Wong, M. S. L., Martins, C., ...
  • Deputy, J.C., Ming, R, Ma H., Liu Z., Fitch M.M., ...
  • Devlin, R. H., &Nagahama, Y. (۲۰۰۲). Sex determination and sex ...
  • Di Stilio, V. S., Kesseli, R. V., &Mulcahy, D. L. ...
  • Doroshov, S. I., Moberg, G. P., & Van Eenennaam, J. ...
  • Duan, W., &Fuerst, P. A. (۲۰۰۱).Isolation of a sex-linked DNA ...
  • Esfandiyari, B., Davarynejad, G. H., Shahriari, F., Kiani, M., &Mathe, ...
  • Feist, G., Van Eenennaam, J. P., Doroshov, S. I., Schreck, ...
  • Flynn, S. R., Matsuoka, M., Reith, M., Martin-Robichaud, D. J., ...
  • Fontana, F., & Colombo, G. (۱۹۷۴).The chromosomes of Italian sturgeons.Experientia, ...
  • Fopp-Bayat, D. (۲۰۱۰). Meiotic gynogenesis revealed not homogametic female sex ...
  • Gill, G. P., Harvey, C. F., Gardner, R. C., & ...
  • Griffiths, R., &Tiwari, B. (۱۹۹۳).The isolation of molecular genetic markers ...
  • Gunter, L. E., Roberts, G. T., Lee, K., Larimer, F. ...
  • Hale, M., McCormick, C., Jackson, J., &DeWoody, J. A. (۲۰۰۹). ...
  • Harshbarger, J.C., Coffey, M.J.& Young, M.Y (۲۰۰۰)Intersexes in Mississippi River ...
  • Hett, A.K., Ludwig, A (۲۰۰۵)SRY-related (Sox) genes in the genome ...
  • Hett, A. K., Pitra, C., Jenneckens, I., & Ludwig, A. ...
  • Horng, Y. M., Chen, Y. T., Wu, C. P., Jea, ...
  • Horng, Y. M., & Huang, M. C. (۲۰۰۳). Male-specific DNA ...
  • Horng, Y. M., Wu, C. P., Wang, Y. C., & ...
  • Hosseini, F.S., ShahsavandHassani, H., Arvin, M.J., Baghizadeh, A. &MohammadiNejad, G. ...
  • Hsu, H.A., Wang, P.H., Chao, M.C., Chan, F.T., Wang, L.M., ...
  • Ii, Y., Uragami, A., Uno, Y., Kanechi, M. and Inagaki, ...
  • Iturra, P., Medrano, J. F., Bagley, M., Lam, N., Vergara, ...
  • Jiang, C. &Sink, K.C (۱۹۹۷) RAPD andSCAR markers linked to ...
  • George, J., Karun, A., Manimekalai, R., Rajesh, M. K., &Remya, ...
  • Keyvanshokooh, S., &Gharaei, A. (۲۰۱۰).A review of sex determination and ...
  • Keyvanshokooh, S., Kalbassi, M.R., Hosseinkhani, S., Vaziri, B (۲۰۰۹) Comparative ...
  • Keyvanshokooh, S., Pourkazemi, M., &Kalbassi, M. R. (۲۰۰۷). The RAPD ...
  • Khadka, D.K., Nejidat, A., Tal, M. &Golan-Goldhirsh, A (۲۰۰۲) DNA ...
  • Koopman, P., Gubbay, J., Vivian, N., Goodfellow, P. &Lovell-Badge, R ...
  • Kovacs, B., Egedi, S., Bartfai, R., Orban, L. (۲۰۰۱) Male-specific ...
  • Lemos, E.G.M., Silva, C.L.S.P. and Zaidan, H.A (۲۰۰۲) Identification of ...
  • Liao, L., Lui, J., Dai, Y., Li, Q., Xia, M., ...
  • Linsen, Z., Qiang, Z., Jinxia, M., Jian, X. &Hua, Z ...
  • Logan, S.H., Johnston, W.E., Doroshov, S.I (۱۹۹۵) Economics of Joint ...
  • Longdou, L., Qibai, X., Meili, J., Wujun, G. &Ruili, L ...
  • McCormick, C. R., Bos, D. H., &DeWoody, J. A. (۲۰۰۸). ...
  • Michelmore, R., Paran, I., &Kesseli, R. V. (۱۹۹۱). Identification of ...
  • Nasrollahzadeh, A. (۲۰۱۰). Caspian Sea and its Ecological Challenges.Caspian Journal ...
  • Omoto, N., Maebayashi, M., Adachi, S., Arai, K.& Yamauchi, K ...
  • Penman, D. J., &Piferrer, F. (۲۰۰۸).Fish gonadogenesis. Part I: genetic ...
  • Persson, H. A., &Nybom, H. (۱۹۹۸).Genetic sex determination and RAPD ...
  • Polley, A., Seigner, E. &Ganal, M.W (۱۹۹۷) Identification of sex ...
  • Pourkazemi, M. (۲۰۰۶). Caspian Sea sturgeon conservation and fisheries: past ...
  • Rana, S., Shirkot, P. and Yadav, M.C (۲۰۰۹) A female ...
  • Reddy, S. R., Krishna, R. B., & Reddy, K. J. ...
  • Roy, S. K., Gangopadhyay, G., & Mukherjee, K. K. (۲۰۱۲). ...
  • Ruas, C.F., Fairbanks, D.J., Evans, R.P., Stutz, H.C., Andersen, W.R. ...
  • Russell, S.R., Sanchez-Soriano, N., Wright, C.R., Ashburner, M (۱۹۹۶)TheDichaete gene ...
  • Sakamoto, K., Abe, T., Matsuyama, T., Yoshida, S., Ohmido, N., ...
  • Samantaray, S., Geetha, K. A., Hidayath, K. P., &Maiti, S. ...
  • Samantaray, S., Phurailatpam, A., Bishoyi, A. K., Geetha, K. A., ...
  • Sharma, A., Zinta, G., Rana, S., &Shirko, P. (۲۰۱۰).Molecular identification ...
  • Shirkot, P., Sharma, D.R. and Mohapatra, T (۲۰۰۲) Molecular identification ...
  • Shirkot, P., Sharma, D.R. &Mohapatra, T. (۲۰۰۲) Molecular identification of ...
  • Shokrollahi, B., &Aryapour, H. (۲۰۱۱).A novel male-specific DNA sequence for ...
  • Sim, M. C., Lim, P. E., Gan, S. Y., &Phang, ...
  • Sinclair, A., Berta, P., Palmer, M., Hawkins, J., Griffiths, B. ...
  • Singh, M., Kumar, S., Singh, A.K. &Kalloo, G. (۲۰۰۲) Female ...
  • Torjek, O., Bucherna, N., Kiss, E., Homoki, H., Finta-Korpelova, Z., ...
  • Underwood, A. P., &Bianco, A. E. (۱۹۹۹).Identification of a molecular ...
  • Urasaki, N.,Tokumoto, M.,Tarora, K.,Ban, Y., Kayano, T.,Tanaka, H., Oku, H., ...
  • VanEenennaam, J.I.&Doroshov, S.I (۱۹۹۸) Effects of age and body size ...
  • Van Eenennaam, A.L., Van Eenennaam, J.P., Medrano, J.F.&Doroshov, S.I (۱۹۹۹) ...
  • Xia, X., Zhao, J., Du, Q., Zhi, J. & Chang, ...
  • Xiang-feng, L., Zheng-hong, S., &Xue-cheng, Z. (۱۹۹۸).Application of RAPD in ...
  • Xu, W.J., Wang, B.W. & Cui, K.M (۲۰۰۴) RAPD and ...
  • Webb M A. H., Feist G. W., Foster E. P.,Schreck ...
  • Wright, E.M., Snopek, B., Koopman, P (۱۹۹۳)Seven new members of ...
  • Wu, C.P., Horng, Y.M., Wang, R.T., Yang, K.T. &Huang, M.C ...
  • Yarmohammadi, M., Pourkazemi, M., Ghasemi, A., Hassanzadeh Saber, M., &Chakmehdouz, ...
  • Younis, R.A.A., Ismail, O.M. &Soliman, S.S (۲۰۰۸) Identification of Sex-specific ...
  • نمایش کامل مراجع