آرایش عناصر ژنتیکی متحرک در میان زیرجمعیت ویروس Escherichia coli سویه های نوع۱۳۱ بامقاومت ضد میکروبی بالا و محتوای ژن ویروسی

توالی اشریشیا کلی نوع ۱۳۱ (ST۱۳۱) به دلیل سهم خود در مقاومت چند دارویی شناخته شده است و گسترش جهانی اینکلون به یک مشکل جهانی تبدیل شده است. درک روندها در میان کلادهای ST۱۳۱ به طراحی استراتژی ها برای جلوگیریاز انتشار سریع آن کمک می کند. در این مطالعه، ۷۲ سویه ST۱۳۱ تحت آنالیز ژنومی مقایسه ای قرار گرفتند و ۶۴ سویهکلاد C با سویه های کلاد C گزارش شده از مناطق دیگر با استفاده از داده های توالی یابی کل ژنوم در دسترس عموم مقایسهشدند . . سویه های C۱ (n = ۳۱ [%۴۸.۴]) و C۲ (n = ۳۳ [%۵۱.۵]) شیوع یکسانی در مجموعه ما داشتند، و سویههای C۱-M۲۷ (n = ۲۲) ارتباط نزدیکی داشتند، دارای یک نوع پلاسمید منحصر به فرد ) F۱: A۲: B۲۰ ( بودند و ویروسC را نشان دادند. حذف ۱۱ سویه C۲ با الگوهای ویروسی متنوع و نوع ناهمگن IncF ، ۲۲ سویه ویروسی E/F نزدیک به هممرتبط با نوع مشابه F۳۱/F۳۶: A۴: B۱ را شناسایی کرد، و آنچه را که نشان میدهیم تشکیل میدهد. به عنوان "زیر مجموعهC۲ ". در یک زمینه جهانی، زیرمجموعه C۲ یک خوشه متمایز با سویههای ویروس بینالمللی E را تشکیل و یک جزیره ژنومی،GI-pheU را در خود جای داده است. ارتباط ژنهای cnf۱/hlyCABD با ۱ تا ۷ عنصر ژنتیکی متحرک، عمدتا ترکیبIS۶۸۲/ISKpn۳۷ در GI-pheU شناسایی شد. زیر مجموعه C۲ برای مقاومت بیش از حد / حدت زیرشاخه C۲ نسبت بهسویه های C۱ ب ه حساب می آید. علاوه بر این، یک ترانسپوزون کامپوزیتی با واسطه IS۲۶ کروموزومی ) IS۱۵DIV-ISEcp۱-blaCTX-M-۱۵-WbuC متالوپروتئین تاشوی کوپین- Tn۲-IS۱۵DIV ( در زیر مجموعه C۲ مشاهده شد. گسترشموضعی زیرمجموعه C۲ در بیمارستان مورد مطالعه، با حمل نشانگرهای حدت/مقاومت بالاتر و یک پلاسمید نوع F عجیب وغریب، پتانسیل تنوع در دودمان ST۱۳۱ و ظهور زیرجمعی تهایی با پتانسیل بقای بالاتر که شیوع های مرتبط با مراقبت هایبهداشتی را باعث میشود، را نشان میدهد

کلیدواژه ها:

ST۱۳۱ ، توالی یابی کل ژنوم ، همولیزین ، جزیره ژنومی ، فیلوژنی SNP ، حدت ، cgMLST ، ایران ، سیتوتوکسین ، فاکتورهای حدت