Population genetic structure of Ustilago maydis in Iran
محل انتشار: Journal of Crop Protection، دوره: 11، شماره: 4
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 51
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCP-11-4_006
تاریخ نمایه سازی: 13 آبان 1402
چکیده مقاله:
The fungus Ustilago maydis causes common smut disease in corn. Under favorable conditions, it can cause severe damage to corn. In this study, the genetic structure of U. maydis populations in Iran from the most corn-growing regions of seven provinces, including Ardebil, Fars, Isfahan, Kerman, Kermanshah, Khuzestan, and Qazvin, was evaluated using rep-PCR with primers; BOX, ERIC, and REP. Rep-PCR reactions with ۱۰۹ isolates of U. maydis produced seven distinct clusters consistent with their geographical origin with few exceptions. The results of AMOVA revealed significant genetic differences within and between pathogen populations. The Euclidean similarity coefficient and the UPGMA algorithm indicate five distant clusters based on the disease severity index. The mean comparison of the disease severity index grouped target isolates into ۱۸ clades using the Tukey test. Our findings showed that the pathogenicity assay-based grouping was not consistent with those of the geographical origin of the isolates nor their genetic similarity.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Hassan Momeni
Plant Disease Research Department, Iranian Research Institute of Plant Protection (IRIPP), Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran.
Fahimeh Nazari
Plant Disease Research Department, Iranian Research Institute of Plant Protection (IRIPP), Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :