تحلیل رفتار DNA در گذر از ریز ساختارها بر اساس معادله فوکر-پلانک و مدل سد آنتروپی

حرکت مولکولهای DNA از میان یک آرایه شش وجهی از ستونهای ریز تحت میدان الکتریکی یکنواخت به عنوان یک فرآیند فوکر-پلانک که متاثر از مدل سدآنتروپی نیز هست به وسیله کامپیوتر شبیه سازی شد و معادله فوکر-پلانک حاکم بر رفتار آنها به روش شبیه سازی عددی دینامیک براونی، با روش اولر حل شد. میانگین زمانی سرعت، واریانس و میانگین < x۲ > در یک زمان معین، برای مولکولهای مختلف DNA در شرایط مختلف محاسبه و با نتایج دیاگرام فاز حاصل از نتایج قبلی ما [۱۹] مقایسه شد. با مقایسه این نتایج توانستیم به فیزیک حاکم بررفتار DNA در رژیمهای مختلف پی ببریم. روشن شد که در رژیم -۱ دیاگرام فاز مذکور (DNAهای کوچک در میدانهای ضعیف)، با یک پدیده پخش خالص مواجه هستیم، در رژیم -۳ (DNAهای بزرگ در میدانهای قوی ) فیزیک حاکم بر رفتار DNA، مدل سدآنتروپی است و در رژیم-۲ ( DNAهای با طول متوسط در میدانهای متوسط و نسبتا قوی [۱۹]) که رژیم پیچیدای است با یک پدیده پخش تحت نیرو روبرو هستیم که بی تاثیر از مدل سد آنتروپی نیز نیست.

کلیدواژه ها:

فرآیند فوکر-پلانک ، مدل سد آنتروپی ، معادله لانژون ، زمان تاخیر