انگشت نگاری ژنتیکی جدایه های باکتری اشریشیا کلی جمع آوری شده از حیوانات باغ وحش کرمان با روش ERIC-PCR
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 422
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NFVM-6-1_004
تاریخ نمایه سازی: 1 مرداد 1402
چکیده مقاله:
انگشت نگاری ژنتیکی سویه های باکتری اشریشیاکلی در یک زیستگاه می تواند کمک شایانی به درک ما از تنوع ژنتیکی و چرخش آنها در میزبان های مختلف کند. در این مطالعه، تعداد ۴۸ نمونه مدفوع از ۲۴ نوع گونه حیوان سالم در باغ وحش کرمان توسط سوآپ استریل جمع آوری شد. پس از جداسازی اشریشیاکلی، سویه ها با روش ERIC-PCR، انگشت نگاری ژنتیکی شده و الگوی باندهای به دست آمده از الکتروفورز با نرم افزار Gel Quest کالیبره و تجزیه و تحلیل شد. در گام بعد شباهت انواع ERIC با ترسیم درخت فیلوژنتیک توسط نرم افزار Cluster Viz با استفاده از الگوریتم UPGMA نشان داده شد. در این روش با قطع تشابه ≥۹۰ درصد، ۲۲ کلون مورد شناسایی قرار گرفت؛ الگوی ERIC جدایه های کبوتر با یک جدایه از طاووس، همچنین جدایه های شترمرغ با یک جدایه از طاووس، شباهت ۱۰۰ درصدی داشت. جدایه های مرغ شاخدار، کاسکو و یک جدایه از شاه بوف با شباهت ۱۰۰درصدی از نظر الگوی ERIC در کنار هم قرار گرفتند. همچنین جدایه های شتر و یک جدایه از شاه بوف شباهت ۱۰۰ درصدی را در الگوی ERIC از خود نشان دادند. با توجه به اینکه چندین سویه جدا شده از میزبان های مختلف با گونه های متفاوت دارای شباهت ۱۰۰ درصد در الگوی ERIC بودند، می توان نتیجه گرفت به علت نزدیک بودن این گونه های مختلف حیوانی در یک زیستگاه مانند باغ وحش، باعث شده است که این سویه ها در بین حیوانات مختلف در گردش باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
لاله سعادت
دانش آموخته دکتری حرفه ای دامپزشکی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
مازیار جاجرمی
استادیار، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
ندا اسکندرزاده
استادیار، گروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
رضا قنبرپور
استاد، گروه میکروبیولوژی مولکولی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :