ارزیابی مخازن ویروس سارس کوید۲ بر اساس آنالیز فیلوژنتیک توالی آمینواسیدهای پروتیین سطحی S و گیرنده سلولی آنزیم مبدل آنژیوتنسین (ACE۲)

ویروس سارس کوید۲ دارای ساختاری کروی شکل است که حاوی پروتیین های M، E، N و S می باشد. پروتیین سطحیS این ویروس نقش مهمی در اتصال ویروس به گیرنده سطحی سلولی ACE۲ میزبان دارد. هدف از این تحقیق ارزیابی مخازن ویروس سارس کوید۲ بر اساس ارتباط فیلوژنتیک توالی آمینو اسیدهای پروتیین سطحی S ویروس و گیرنده سطحی سلولی ACE۲ در موجودات مختلف می باشد. برای انجام این تحقیق توالی کامل ژنوم، توالی آمینو اسیدهای پروتیین سطحی S ویروس سارس کوید۲ و توالی آمینو اسیدهای گیرنده سطح سلول ACE۲ برخی حیوانات و انسان از وبگاه NCBI و  GenBankگرفته شد و با استفاده از نرم افزار مگاx  روابط فیلوژنتیکی مورد آنالیز قرار گرفت. نتایج به دست آمده نشان داد که ویروس های سارس کوید۲ جدا شده از مناطق جغرافیایی مختلف دارای منشا مشترکی بودند. آنالیز پروفایل آمینو اسیدهای پروتیین سطحی S در واریته های مختلف نشان دهنده تغییرات زیاد و سرعت جهش در ژنوم این ویروس ها می باشد. از طرف دیگر توالی آمینو اسیدهای پروتیین ACE۲ انسان شباهت زیادی به حیواناتی مانند خوک، شتر، خفاش، روباه پرنده و خفاش میوه خوار داشت که نشان دهنده مخزن های مختلف ویروس می باشد. بنابر این جهش ژنی در ناحیه کدکننده پروتیین سطحیS این ویروس و تشابه توالی آمینو اسیدهای پروتیینACE۲  در موجودات مختلف می تواند باعث ظهور واریته های جدید ویروس در مخازن گوناگون حیوانی گردد که این پدیده احتمال سرایت ویروس را به انسان، حتی پس از واکسیناسیون و ایجاد ایمنی گروهی افزایش می دهد.

کلیدواژه ها:

آنالیز فیلوژنتیک ، سارس کوید۲ ، Sپروتیین ، ACE۲