شناسایی اکوتیپ ها و گونه های مختلف مرزه (Satureja spp.) با استفاده از بارکدینگ DNA
محل انتشار: دوفصلنامه علوم سبزی ها، دوره: 6، شماره: 1
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 115
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IUVS-6-1_007
تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401
چکیده مقاله:
برخی از گیاهان دو منظوره سبزی-دارویی منابع ارزشمندی هستند که در کشورهای در حال توسعه و پیشرفته مورد توجه قرار گرفته و به عنوان سبزی تازهخوری یا مواد اولیه جهت تبدیل به داروهای بیخطر برای انسان تلقی میشوند. روش بارکدینگ مولکولی ابزار قابل اعتمادی برای شناسایی گیاهان در سطح جنس و گونه است. در این تکنیک بخش کوچکی از ژنوم گیاه توالی یابی شده و برای شناسایی و تعیین ارتباط بین گونه های مختلف یک جنس استفاده می شود. در پژوهش حاضر ۷ اکوتیپ از گیاه مرزه (S. horentiss, S. bakhtiari, S. biossier, S. mutica, S. bakhtiari) با استفاده از بارکدینگ DNA بررسی شد. DNA ژنومی در سال ۱۳۹۷ در آزمایشگاه بیوتکنولوژی دانشگاه ایلام استخراج گردید و PCR با استفاده از آغازگر های اختصاصی برای ژن های matK، rbcL و ITS انجام شد. پس از خالصسازی محصولات PCR مشخص شد که از ژنهای مورد بررسی فقط ژن matK کیفیت مناسبی جهت تفکیک نمونه را نشان داد. همچنین نتایج جستجوی نوکلئوتیدی نشان داد که شباهت بسیار بالایی (بیش از ۹۶ درصد) بین توالی های بدست آمده و توالی های پایگاه NCBI وجود دارد. تجزیه خوشه ای با روش UPGMA ژن matK نشان داد که نمونههای S. biossier و S. bakhtiarica ایلام و گیلان به همراه نمونه S. hortensis بیرجند و یزد در یک گروه قرار گرفتند و نمونههای S. bakhtiari یزد و S. mutica خراسان در گروه دوم قرار گرفتند. نتایج کلی این تحقیق نشان می دهد که با استفاده ازتوالییابی ژن matK میتوان نمونهها را از لحاظ منشاء جغرافیایی از همدیگر تفکیک نماید.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
طاهره پیری
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد
آرش فاضلی
۲. دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، نویسنده مسئول، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام