۳D-QSAR Modeling of Anti-oxidant Activity of some Flavonoids

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 133

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ANALCH-6-2_004

تاریخ نمایه سازی: 16 بهمن 1401

چکیده مقاله:

The anti-oxidant activities for a diverse set of flavonoids as TEAC (Trolox equivalent anti-oxidant capacity), assay were subjected to ۳D-QSAR (۳ dimensional quantitative structural-activity relationship) studies using CoMFA (comparative molecular field analysis) and CoMSIA (comparative molecular similarity indices analysis). The obtained results indicated superiority of CoMSIA model over CoMFA model. The best CoMSIA model is developed by using hydrogen-bond donor (H-bond donor) and electrostatic field components. This model gave the cross-validated correlation coefficient, Q۲ = ۰.۵۱۲, correlation coefficient, R۲ = ۰.۹۵۰, standard error of prediction, SE = ۰.۲۸۴, and F = ۴۷.۳, for training set, R۲ = ۰.۹۲۲ and SE = ۰.۲۸۶, for test set indicating robustness and high prediction power of the developed model. The contour maps of electrostatic and H-bond donor fields of CoMSIA model provide interpretable and fruitful relationship between chemicals structure and their anti-oxidant activities, which give useful insights for designing new compounds with higher activity.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

Fateme Rostamnejhad

Laboratory of Chemometrics, Faculty of Chemistry, University of Mazandaran, Babolsar, Iran

Mohammad Hossein Fatemi

Laboratory of Chemometrics, Faculty of Chemistry, University of Mazandaran, Babolsar, Iran

Mahsa Samghani

Laboratory of Chemometrics, Faculty of Chemistry, University of Mazandaran, Babolsar, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • J.B. Harborne, C.A. Williams, Phytochemistry. ۵۵ (۲۰۰۰) ۴۸۱ ...
  • B. Havsteen, Biochem. Pharmacol. ۳۲ (۱۹۸۳) ۱۱۴۱ ...
  • M. Gabor, Prog. Clin. Biol. Res. ۲۱۳ (۱۹۸۶) ۴۷۱ ...
  • V. Breinholt, A. Hossaini, G.W. Svendsen, C. Brouwer, S. Nielsen, ...
  • C.-Q. Hu, K. Chen, Q. Shi, R.E. Kilkuskie, Y.-C. Cheng, ...
  • J. Olivero-Verbel L. Pacheco-Londoño, J. Chem. Inf. Comput. Sci. ۴۲ ...
  • S. Ramos, J. Nutr. Biochem. ۱۸ (۲۰۰۷) ۴۲۷ ...
  • W. Ren, Z. Qiao, H. Wang, L. Zhu, L. Zhang, ...
  • W. Bors, M. Saran, Free Radical Res. ۲ (۱۹۸۷) ۲۸۹ ...
  • H.F. Ji, H.Y. Zhang, J. Mol. Struct. ۷۶۷ (۲۰۰۶) ۳ ...
  • S. Teixeira, C. Siquet, C. Alves, I. Boal, M.P. Marques, ...
  • B.J. Lumbiny, Z. Hui, M.A. Islam, J. Asiat. Soc. Bangladesh, ...
  • R. Blomhoff, Curr. Opin. Lipidol. ۱۶ (۲۰۰۵) ۴۷ ...
  • J. Lee, N. Koo, D. Min, Comp. Rev. Food Sci. ...
  • J.W. Chen, Z.Q. Zhu, T.X. Hu, D.Y. Zhu, Acta Pharmacol. ...
  • K.E. Heim, A.R. Tagliaferro, D.J. Bobilya, J. Nut. Biochem. ۱۳ ...
  • T. Yokozawa, C.P. Chen, E. Dong, T. Tanaka, G.I. Nonaka, ...
  • M.J. Arts, G.R. Haenen, H.P. Voss, A. Bast, Food Chem. ...
  • C.A. Rice-Evans, N.J. Miller, G. Paganga, Free Radical Biol. Med. ...
  • R.M. Abreu, I.C. Ferreira, M.J.R. Queiroz, Eur. J. Med. Chem. ...
  • M.H. Fatemi, E. Gholami Rostami, Ind. Eng. Chem. Res. ۵۲ ...
  • D.S. Puntambekar, R. Giridhar, M. Yadav, Acta Pharm. Zagerb. ۵۶ ...
  • W. Samee, J. Ungwitayatorn, C. Matayatsuk, J. Pimthon, Science Asia. ...
  • T. Saraswathy, N. Ramalkshmi S. Arunkumar, Int. J. Pharm. Pharma. ...
  • P. Jing, S. Zhao, S. Ruan, Z. Sui, L. Chen, ...
  • B. Chen, Z. Zhu, M. Chen, W. Dong, Z. Li, ...
  • A.G. Maldonado, J.P. Doucet, M. Petitjean, B.T. Fan, Mol. Diversity ...
  • G. Klebe, U. Abraham, J. Comput. Aided Mol. Des. ۱۳ ...
  • G. Klebe, U. Abraham T. Mietzner, J. Med. Chem. ۳۷ ...
  • R. Thaimattam, P. Daga, S.A. Rajjak, R. Banerjee, J. Iqbal, ...
  • B. Wendt, R.D. Cramer, J. Comput. Aided Mol. Des. ۲۸ ...
  • C. Xue, S. Cui, M. Liu, Z. Hu, B. Fan, ...
  • W. Zhu, G. Chen, L. Hu, X. Luo, C. Gui, ...
  • G. Schüürmann, R.U. Ebert, J. Chen, B. Wang, R. Kühne, ...
  • نمایش کامل مراجع