A ۲-D QSAR Modeling, Molecular Docking Study and Design of ۲-Arylbenzimidazole Derivatives as Novel Leishmania Inhibitors: A Molecular Dynamics Study
محل انتشار: نشریه پیشرفته شیمی، دوره: 6، شماره: 1
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 130
فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AJCS-6-1_004
تاریخ نمایه سازی: 29 آذر 1401
چکیده مقاله:
Leishmaniasis, a neglected tropical disease, affects a human population of over ۱۲ million people, mainly in the tropics, and is caused by the leishmanial parasites transmitted by the female sand fly. The lack of vaccines to prevent leishmaniasis, and the limitations of existing therapies necessitated this study, which was focused on the computational design of some novel ۲-arylbenzimidazole analogs while subjecting the same to molecular docking, pharmacokinetics, and Molecular Dynamic (MD) simulation to ascertain their drug-ability. The obtained QSAR model was validated as follows: R۲ = ۰.۸۴۴۷, R۲adj = ۰.۸۰۹۵, Q۲cv = ۰.۶۷۹۹, and R۲test = ۰.۷۳۸۳. The predicted pIC۵۰ values of all newly designed compounds were higher than that of the lead compound (۱۳). The newly designed analogs conformed to Lipinski's rule for oral bio-availability less ۱۳m, and showed good ADMET properties, with ۱۳j showing the highest Human Intestinal Absorption (HIA) of ۹۳.۶۴%. The MD simulation result demonstrated excellent stability associated with the binding of ۱۳j onto ۶K۹۱'s binding pocket with an estimated ∆G binding (MM/GBSA) of -۵۰.۴۰۳۱ kcal/mol than that of ۱۳_۶K۹۱ (∆G binding = -۲۵.۹۶۶۵ kcal/mol). Therefore, ۱۳j could be recommended as a potential drug molecule for treating leishmanial infections.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Fabian Ugbe
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B.۱۰۴۵, Zaria, Kaduna State, Nigeria
Gideon Shallangwa
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B.۱۰۴۵, Zaria, Kaduna State, Nigeria
Adamu Uzairu
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B.۱۰۴۵, Zaria, Kaduna State, Nigeria
Ibrahim Abdulkadir
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B.۱۰۴۵, Zaria, Kaduna State, Nigeria
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :