روش جدید برای تشخیص سرطان سینه با استفاده از داده های بیان ژن و الگوریتم بهینه سازی امواج آب

سرطان سینه امروزه یکی از مباحث مهم در زمینه سلامت عمومی محسوب می شود که رایج ترین نوع سرطان و همچنین اصلی ترین عامل مرگ میر بر اثر سرطان در میان زنان است. درمان های نوین برای هدف قرار دادن انواع خاص سرطان و کاهش اثرات مضر آنها(نظیر اختلال عملکرد قلب، یائسگی زودرس و غیره) توسعه داده شده اند. DNA Microarrays ابزارهای قدرتمندی برای طرح یک شمای ژنتیکی از نمونه ی زیستی (مثل تومورها) توسط سنجش بیان ژن در بافتها، سلول ها و شرایط مختلف و همچنین فراهم آوردن اطلاعات روی سطوح مرتبط به بیان هزاران ژن در میان نمونه ها هستند. داده های میکروآرایه در تشخیص و طبقه بندی انواع بافتهای سرطانی نقش به سزایی دارند. در این مقاله با استفاده از داده های میکروآرایه و تکنیک های داده کاوی روشی نوین برای تشخیص سرطان سینه سه گانه منفی ارائه شده است. ابعاد بالا و تعداد نسبتا کم نمونه ها در میکروآرایه باعث ایجاد مشکلاتی در طراحی طبقه بندی کننده ها شده است. بنابراین داده های میکروآرایه قبل از طبقه بندی از طریق روشهای انتخاب ژن، پیش پردازش و ژن های فاقد اطلاعات دور ریخته میشوند. نتیجه این اقدام کاهش ژن های نامرتبط، افزایش دقت طبقه بندی و تشخیص و پیش بینی بهتر بیماری و درنتیجه اعمال روش های درمانی مختلف است. جهت کاهش ابعاد از الگوریتم بهینه سازی امواج آب Water Waves Optimization استفاده شده است و سپس توسط روش طبقه بندی K-Nearest Neighborhood KNN طبقه بندی و تشخیص نوع سرطان سینه سه گانه منفی صورت گرفته است.

کلیدواژه ها:

کلمات کلیدی-سرطان سینه ، میکروآرایه ، الگوریتم Water Wave Optimization