شناسایی مکانیزم تعامل lncRNA-miRNA-mRNA در سرطان پستانبر اساس تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی

RNAهای غیر کدشونده نقش مهمی در تنظیم بیان ژن های خاص دارند و در فرایندهای بیولوژیکی سرطان پستان دخیل هستند .اکثریت مطالعات بر تعریف فعالیت های تنظیمی RNA های غیر کدشونده طولانی (lncRNAs) و microRNAs (miRNAs / miRs) متمرکز شده اند و مطالعات اندکی در باره چگونگی رونویسی چگونه lncRNAs و miRNAs انجام شده است .در مطالعه حاضر، بر اساس مجموعه داده های کارسینوم مهاجم پستان از Atlas Genome Cancerدر cBioPortal و با استفاده از رویکرد محاسباتی بیوانفورماتیک، یک شبکه lRNA-miRNA-mRNA ساخته شد .این شبکه شامل ۶۰۱گره و ۷۰۶ لبه بود که نشان دهنده شبکه پیچیده ای از اثرات تنظیمی بینlncRNAs ، miRNAs و ژن های هدف است .نتایج این مطالعه نشان داد که miR-۵۱۰قویترین گیرنده و تنظیم کننده miRNA تعداد زیادی ژن هدف است .عالوه بر این، مشاهده شد کهlncRNAs PVT۱ ، CCAT۱ و linc۰۰۸۶۱ تعامل های احتمالی با بیومارکرهای بالینی، شامل پروتئین گیرنده تیروزیین پروتئینkinase erbB-۲ ، گیرنده استروژن و گیرنده پروژسترون اثبات شده با استفاده از نرم افزار پیش بینی ارتباط متقابل پروتئینRNA -را نشان داد، شبکه تعامل lncRNA-miRNA-mRNA مطالعات تجربی بیشتری را تسهیل می کند و ممکن است برای تسهیل پیش بینی های biomarker برای توسعه روش های درمان جدید در سرطان پستان استفاده شود .

کلیدواژه ها:

سرطان پستان ، RNA طوالنی غیر کدشونده ، میکروارنا ، mRNA ، بیوانفورماتیک