مدل های بیزی در انطباق پروتئین ها

در این مقاله راه حل های احتمالاتی مسئله انطباق ساختار سوم پروتئین و تفاوت آن با الگوریتم های قطعی مطالعه و بررسی می شود. برای این منظور دو مدل احتمال بیزی معرفی و راه حلی در خصوص اضافه کردن اطلاعات توالی و نوع اسید آمینه (ساختار اول) به آن ارائه خواهد شد. همچنین نحوه برآورد پارامترهای انطباق به کمک الگوریتم مونت کارلوی زنجیر مارکف و نمونه گیری از توزیع پسین معرفی می شود. در نهایت نحوه کاربست این روش ها در انطباق پروتئین ها نشان داده شد و برآورد پارامترها در مدل های متفاوت برای یک مجموعه داده واقعی ارزیابی و مقایسه خواهد شد.

کلیدواژه ها:

Statistical Shape Analysis ، Size-and-shape Distance ، Bioinformatics ، Structural Alignment of Protein ، Tertiary Structure of Protein ، Bayesian Inference ، آمار شکل ، فاصله اندازه شکل ، بیوانفورماتیک ، انطباق ساختاری پروتئین ، ساختار سوم پروتئین ، استنباط بیزی