بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های Agropyron cristatum (L.) Garetn. با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD
- سال انتشار: 1388
- محل انتشار: مجله فیزیولوژی محیطی گیاهی، دوره: 4، شماره: 14
- کد COI اختصاصی: JR_ECOP-4-14_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 127
نویسندگان
دانش آموخته دوره دکتری تخصصی رشته اصلاح نباتات، واحد علوم و تحقیقات دانشگاه آزاد اسلامی، تهران
دانشیار، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، تهران
استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل
استادیار، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، کرج
چکیده
در این پژوهش، از نشانگر مولکولی چندشکلی قطعات تکثیر شده تصادفی DNA (RAPD) برای تعیین تنوع ژنتیکی ۱۰ جمعیت Agropyron cristatum (L.) Garetn. استفاده شد. قطعات چندشکلی بوسیله ۱۰ آغازگر اختیاری ۱۰ نوکلئوتیدی از میان ۵۰ آغازگر تولید گردید. در مجموع ۵۸ نوار چندشکل که دارای تکرارپذیری بالایی بودند، انتخاب و وارد محاسبات شدند. ضرایب تشابه ژاکارد بر اساس حضور و عدم حضور باندها محاسبه گردید. دامنه ضرایب تشابه از ۱۷/۰ تا ۳۷/۰ متغیر بود. بیشترین تشابه ژنتیکی بین جمعیت های ۷۸۴۴ (بافت) با ۳۰۲۹ (بجنورد) و کمترین تشابه ژنتیکی بین ۴۳۳۶ (کرمان) با ۴۰۵۶ (چادگان) و ۲۰۸ (اصفهان) با ۱۷۲۷ (گرگان) مشاهده شد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنوع بین جمعیت ها و درون جمعیت ها معنی دار و از مجموع تنوع کل، سهم بین جمعیت ها و درون جمعیت ها به ترتیب ۴۶/۱۳ و ۵۴/۸۶ درصد بود. میانگین درجه تمایز ژنی (۱۵/۰=FST ) نشان داد که درصد بالایی از تنوع کل مربوط به تنوع درون جمعیت ها بود. تجزیه کلاستر با استفاده از ضرایب تشابه ژاکارد مبتنی بر روش ادغام بر حسب متوسط گروه ها (UPGMA) انجام گرفت و جمعیت ها در سه گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج تجزیه به مولفه های هماهنگ اصلی به طور قوی نتایج تجزیه کلاستر را تایید کرد. گروه بندی جمعیت ها با استفاده از تجزیه کلاستر با الگوی جغرافیایی محل رویش آنها مطابقت زیادی نداشت ولی با نتایج مطالعات مورفولوژیکی که قبلا بر روی جمعیت ها انجام شده بود همخوانی خوبی داشت و با توجه به نتایج این تحقیق در شرایط آزمایش کنترل شده، نشانگرهای RAPD می توانند وسیله ای مناسب و موثر در ارزیابی تنوع ژنتیکی بین جمعیت های A. cristatum باشند.کلیدواژه ها
الکتروفورز, تجزیه واریانس مولکولی, تجزیه خوشه ای, تنوع ژنتیکی, چندشکلی, Agropyron cristatum, FST, RAPDاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.