آنالیز ترادف نوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت و بررسی منشاء و تکامل آن
محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 51، شماره: 1
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 122
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJPP-51-1_006
تاریخ نمایه سازی: 7 اردیبهشت 1401
چکیده مقاله:
ترادف کاملنوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus MDMV-Ir) تعیین گردید. ژنوم ویروس بجز دنباله Poly A انتهایی ʹ۳، ۹۴۹۹ نوکلئوتید بود که شامل ۱۳۹ نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ ۵ و ۲۳۴ نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ ۳ و یک چارچوب باز خواندنی که یک پلی پروتئین با ۳۰۴۲ اسید آمینه را کد می کند را شامل می شد. MDMV-Ir با سایر جدایه های ویروس۴/۸۶ تا ۹/۹۱ در صد شباهت نوکلئوتیدی و ۹/۹۳ تا ۳/۹۷ در صد شباهت آمینواسیدی دارد. شباهت نوکلئوتیدی MDMV-Ir با ترادف کامل سایر پوتی ویروس های غلات موجود در GenBank ۵۴ تا ۵/۷۰ در صد محاسبه گردید. ترادف آمینو اسیدی پروتئین های ویروس با پروتئین های سایر ویروس های غلات ۸/۲۹ تا ۶۰ در صد مشابهت نشان داد. مقایسه ترادف نوکلئوتیدی و آنالیز فیلوژنتیکی ترادف کامل و پلی پروتئین های حاصله نشان داد که MDMV بیشترین شباهت را با جدایه بلغاری ویروس و در بین پوتی ویروس های غلات بیشترین شباهت را ویروس موزائیک سورگوم دارد. همچنین این آنالیز نشان داد که جمعیت های MDMV یک گروه مونوفیلتیک هستند که از ناحیه مدیترانه منشاء گرفته اند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
فروه سادات مصطفوی نیشابوری
نویسنده
محمود معصومی
مسئول مکاتبه
سعید نصراله نژاد
نویسنده
نرجس رهپیماسروستانی
نویسنده
کرامت اله ایزدپناه
نویسنده