شناسایی فاکتورهای رونویسی موثر در پاسخ به بیمارگرهای قارچی گندم با استفاده از فراواکاوی داده های ریزآرایه

از شایع ترین و مخرب ترین عوامل تنش زیستی در گندم، پاتوژن های قارچی از جمله زنگ می باشد که خسارت قابل توجهیبه محصولات زراعی در مناطق معتدل سراسر جهان وارد می کند. در این تحقیق، به دلیل اهمیت TFs به عنوان ابزاری قدرتمندبرای دستکاری مسیرهای متابولیکی پیچیده، سعی شده است ژن های کدکننده آنها شناسایی شود. بنابراین، از فراواکاوییکپارچه داده های ریزآرایه برای شناسایی مکانیسم های رونویسی مهمی که برای پاسخ به بیمارگرهای قارچی مهم هستند،استفاده شد. بر اساس نتایج فراواکاوی، در مجموع ۱۸۶۵ ژن افتراق بیان (DEGs) به دست آمد. آنالیز iTAK در مجموع ۲۱مورد TF شناسایی کرد که متعلق به ۱۴ خانواده حفاظت شده بودند. ما metaDE را برای جستجوی سیستماتیک عناصرتنظیم کننده cis در پروموتر ژن هایی که رونویسی آن ها را در یک واکنش پیچیده به طور قابل توجهی تغییر دادند، توسعه دادیم.در نهایت توانستیم ۱۱ موتیف حفاطت شده در مناطق بالادستی DEG ها شناسایی کنیم که به نظر می رسد C۲H۲ zinc finger ، bZIP ، MYB ، MADS box factors ، bHLH ، Other C۴ zinc finger و AP۲/ERF عوامل رونویسی اصلی هستند.

کلیدواژه ها:

فراواکاوی ، فاکتور رونویسی ، بیمارگرهای قارچی ، داده های ترنسکریپتوم