Bacterial diversity in the intestine of sea cucumber Stichopus japonicus
محل انتشار: مجله علوم شیلات ایران، دوره: 16، شماره: 1
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 159
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JIFRO-16-1_023
تاریخ نمایه سازی: 27 بهمن 1400
چکیده مقاله:
The intestinal bacterial diversity of Stichopus japonicus was investigated using ۱۶S ribosomal RNA gene (rDNA) clone library and Polymerase Chain Reaction/Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (PCR-DGGE). The clone library yielded a total of ۱۸۸ clones, and these were sequenced and classified into ۱۰۶ operational taxonomic units (OTUs) with sequence similarity ranging from ۸۸ to ۱۰۰%. The coverage of the library was ۷۷.۴%, with approximately ۸۸.۷% of the sequences affiliated to Proteobacteria. Gammaproteobacteria and Vibrio sp. were the predominant groups in the intestine of S. japonicus. Some bacteria such as Legionella sp., Brachybacterium sp., Streptomyces sp., Propionigenium sp. and Psychrobacter sp were first identified in the intestine of sea cucumber
کلیدواژه ها: