Identification and Functional Profiling of Differentially Expressed Extracellular Vesicle-free MicroRNAs for Efficient Prostate Cancer Diagnosis
محل انتشار: مجله سلول و تحقیقات مولکولی، دوره: 12، شماره: 1
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 210
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCMR-12-1_002
تاریخ نمایه سازی: 22 آذر 1400
چکیده مقاله:
MicroRNAs are interesting as cancer diagnostic and prognostic biomarkers because of their unique tissue expression profiles, higher stability in the blood in comparison to mRNAs, and the possibility for reliable quantification. In the case of prostate cancer (PCa), it is currently emphasized to explore new biomarkers, particularly from microRNAs which are freely available in the bloodstream. In this study, the gene expression omnibus database (GEO), a repository of microarray data for PCa circulating extracellular vesicle-free microRNAs profiling, was analyzed for differentially expressed miRNAs (DE-miRs). Top ۲۰ most differentially expressed miRs with significant (adjusted p-value < ۰.۰۱) high expression (fold change) levels were extracted by the simultaneous application of different filtering criteria. Then, microRNA-gene networks were constructed for the two sets of positively (n=۲۰) or negatively (n=۲۰) regulated miRNAs. Gene ontology annotations of the target gene sets were also extracted and analyzed. Results indicated that human miR-۱۵۸۷, miR-۲۲۳-۳p, miR-۳۱۲۵, and miR-۶۴۲b-۳p are highly significant DE-miRs in PCa. In addition, human miR-۴۴۵۹, miR-۱۲۷۳g, miR ۶۴۲a-۳p, and miR-۶۴۲b-۳p were identified as top-ranked hubs in the relevant miRNA-gene networks. FOXK۱, PML, CD۲۴, ATN۱, BAZ۲A, CDKN۱A, NUFIP۲, and HARNPU were identified as microRNA target genes with significant dysregulation. miR-۴۴۵۹, miR-۱۲۷۳g-۳p, miR-۳۱۳۵b, miR-۵۰۰۱-۵p, and miR-۱۵۸۷ were proposed as novel microRNAs with the potential to be utilized as diagnostic biomarkers of prostate cancer among circulating vesicle-free miRNAs.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Mina Jahandideh
Medical Biology Research Center, Health Technology Institute, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran
Ebrahim Barzegari
Medical Biology Research Center, Health Technology Institute, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :