بررسی تنوع ژنتیکی بنفشه آفریقایی با استفاده از مارکر مولکولی RAPD

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و ارزیابی ارقام مطرح بنفشه­ی آفریقایی(Saintpauli ionantha) در سطح مولکولی از نشانگر RAPD استفاده شد. در این تحقیق ۶ ژنوتیپ با ۸ آغازگر مورد ارزیابی قرار گرفتند. از ۸ آغازگر آزمایش شده روی DNA ژنومی ۱۸۰ باند تولید شد که ۱۶۳ باند پلی مورف و ۱۷ باند باقیمانده منومورف بودند. اندازه­ی قطعات DNA تولید شده بین bp۳۰۰ تا kb۴ بود. آغازگرC  ۱۰mer کمترین باند و آغازگر ۱۰mer E بیشترین تعداد باند را تولید کرد. باندهای تولید شده برای آنالیزهای استاتیک مورد استفاده قرار گرفتند. محاسبات آماری براساس ضریب تشابه جاکارد و گروه­بندی به روش دایس با استفاده از نرم­افزار۲/۰۲  Ntsys ver انجام شد. تشابه ژنتیکی بین ۵۷/۰ تا ۷۲/۰ بوده و ضریب جاکارد بین دندروگرام و ماتریس تشابه ۸۵/۰ به دست آمد که نشان دهنده برازش مناسب دندروگرام به ماتریس تشابه بوده است. این آزمایش نشان داد که نشانگر RAPD برای بررسی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپ های بنفشه­آفریقایی یک تکنیک موثر و مفید است.

کلیدواژه ها:

بنفشه ی آفریقایی ، مارکر مولکولی ، تنوع ژنتیکی ، ماتریس تشابه