بررسی اهمیت پارامترهای مدل برای شبکه متابولیک تنظیمی در باکتری اشریشیا کلی

  • سال انتشار: 1400
  • محل انتشار: چهارمین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران
  • کد COI اختصاصی: ICSB04_051
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 452
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

رضوان کریمی

دانشجوی کارشناسی ارشد – دانشکده برق و کامپیوتر، گروه کنترل،دانشگاه تربیت مدرس

سجاد ازگلی

دانشیار – دانشکده برق و کامپیوتر، گروه کنترل، دانشگاه تربیت مدرس

چکیده

شبکه ی متابولیک یک مجموعه ی کامل از فرآیندهای متابولیک است که ویژگی های فیزیولوژی و بیوشیمیایی یک سلول را تعیین می کند. شبکه های متابولیک یک ابزار قدرتمند برای مطالعه و مدلسازی متابولیسم میباشند؛ با توجه به ماهیت دینامیک شبکه های متابولیک، اغلب از دستگاه معادلات دیفرانسیل برای مدلسازی استفاده میشود. این دستگاه معادلات بر اساس قانون بقای جرم برای هریک از متابولیتها تشکیل میشود. معادلات که رفتار سینتیکی آنزیمها را توصیف میکنند، به شدت غیرخطی هستند. همچنین تخمین پارامترهای سینتیکی از دشوارترین مراحل در مدلسازی دینامیکی میباشد؛ بنابراین در این مقاله با به کارگیری ساده ترین شکل سینتیک آنزیمی و ارائه مدل با استفاده از تحلیل حساسیت، میزان اهمیت پارامترهای مدل را مورد بررسی قرار میدهیم.

کلیدواژه ها

شبک متابولیک، مسیرهای متابولیک، شبکه تنظیم ژنی، زیست شناسی سامانه ها، تحلیل حساسیت.

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.