ارزیابی تنوع ژنتیکی و ساختارشناسی توده های خربزه وحشی (Cucumis melo var. agrestis) حاشیه جنوبی دریای خزر با استفاده از نشانگرهای مولکولی AFLP
محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 9، شماره: 21
سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 228
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-9-21_008
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
چکیده مقاله:
خربزه وحشی (Cucumis melo var. agrestis) که به خربزه آفریقایی شهرت دارد، در سراسر مناطق گرمسیری و نیمهگرمسیری جهان پراکنده است. این گیاه یک گیاه دارویی با خواص متعدد درمانی بوده و همچنین ژرمپلاسم مناسبی برای اصلاح خربزه زراعی محسوب میشود. در این بررسی تنوع ژنتیکی تودههای خربزه وحشی استان مازندران با استفاده از نشانگر AFLP مورد ارزیابی قرار گرفت. بدین منظور ۱۶ نمونه خربزه وحشی از نقاط مختلف استان مازندران جمعآوری و توسط ۱۰ جفت آغازگر AFLP مورد ارزیابی قرار گرفتند. در مجموع تعداد ۵۶۴ نوار امتیازدهی گردید که بیش از ۶۸ درصد از آنها چند شکلی نشان دادند. میانگین محتوای اطلاعاتی چندشکلی (PIC) و شاخص نشانگری (MI) به ترتیب ۲۲/۰ و ۵۱/۱۵ محاسبه شدند و بیشترین شاخص نشانگری (۱۹/۲۴) توسط ترکیب آغازگرهای E-CCA , M-GAG حاصل شد. همچنین بر اساس شاخص تنوع شانون ترکیب آغازگری E-CCA, M-GAG با مقدار (۳۳/۰) بیشترین تنوع را نشان داد. تجزیه خوشهای با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و الگوریتم UPGMA و همچنین گروهبندی به روش بیزین، نمونهها را به پنج گروه تقسیم کردند. نتایج پلات مختصات اصلی با گروهبندی براساس مدل بیزین و تجزیه خوشهای تطابق کامل داشت. تنوع ژنتیکی مشخص شده بوسیله نشانگرهای AFLP در این پژوهش نشاندهنده این است که این نشانگر قادر به تفکیک نمونهها و خوشهبندی مطابق با محل جغرافیایی است و همچنین میتواند برای شناسایی تفاوتهای درون گونهای در مطالعات تبارشناسی استفاده شود.
کلیدواژه ها:
Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) marker ، Bayesian method ، Genetic Diversity ، Wild melon ، تنوع ژنتیکی ، خربزه وحشی ، روش بیزین ، نشانگر AFLP
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :