ارزیابی کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تنوع ژنتیکی توده های گیاه دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare)
محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 9، شماره: 24
سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 466
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-9-24_011
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
چکیده مقاله ارزیابی کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تنوع ژنتیکی توده های گیاه دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare)
یکی از قدیمیترین گیاهان دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare) میباشد که در طب سنتی کاربرد فراوان دارد. در این تحقیق، تنوع ژنتیکی ۱۶ توده ایرانی رازیانه تهیه شده از بانک ژن سازمان جنگلها و مراتع با استفاده از ۱۵ آغازگر SCoT (Start codon targeted) مورد ارزیابی قرار گرفت. آغازگرهای SCoT در مجموع توانستند ۷۷ باند تولید کنند که از این تعداد، ۴ باند
یکشکل مشاهده شد. آغازگرهای SC۵ و SC۲۹ بهترتیب با ۱۰ و ۹ باند بیشترین تعداد و آغازگرهای SC۱۰، SC۲۶ و SC۴۴ با ۲ باند کمترین تعداد باند را نشان دادند. شاخصهای محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC)، شاخص نشانگری (MI)، نسبت چندگانه موثر (EMR) و شاخص قدرت تفکیک (RP) برای کلیه نشانگرها محاسبه گردید که با توجه به شاخصهای محاسبه شده آغازگرهای SC۱۵ و SC۶۳ بهعنوان بهترین آغازگرها جهت بررسی تنوع ژنتیکی رازیانه معرفی گردید. میزان شباهت ژنتیکی مشاهده شده براساس اطلاعات این نشانگرها برابر ۶۶/۰ بود. بیشترین تشابه ژنتیکی در میان توده ۶ (اردبیل ۱) با تودههای ۷ (اردبیل ۲) و ۸ (تهران ۱)، و کمترین تشابه را توده ۱۵ (قزوین) با ۵ (یزد) داشت. نتایج حاصل از گروهبندی تجزیه خوشهای
بهروش UPGMA بر اساس ضریب تشابه جاکارد تودهها در ۴ گروه قرار داد که بر اساس تجزیه به مختصات اصلی (PCo) و تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) گروههای حاصل از تجزیه کلاستر تایید گردید بر طبق این گروهبندی واریانس بین گروهها در سطح ۵% معنیدار بود، اما براساس واریانس برآورد شده سهم واریانس بین گروهها تنها ۲۴ درصد از تنوع کل بود.
کلیدواژه های ارزیابی کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تنوع ژنتیکی توده های گیاه دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare) :
نویسندگان مقاله ارزیابی کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تنوع ژنتیکی توده های گیاه دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare)
فریبا نیک کردار
Department of Agriculture, Payam Noor University
محسن فرشادفر
Department of Agriculture, Payam Noor University
محمدعلی ابراهیمی
Department of Agriculture, Payam Noor University
هومن شیروانی
Department of Agriculture, Payam Noor University
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :