مقایسه کارایی نشانگرهای RAPD وSCoT در تعیین تنوع ژنتیکی ارقام آنتوریوم (Anthurium andreanum) و تعیین روابط ژنتیکی بین آنها

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 305

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-10-28_010

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

بررسی تنوع ژنتیکی برای انجام برنامه­ های اصلاحی ضروری می­ باشد. به­منظور بررسی تنوع ژنتیکی ۱۰ رقم آنتوریومA. andreanum  از هفت نشانگر SCoT و ۴۰ نشانگر  RAPDاستفاده شد که در این مجموعه ۲۲ نشانگر RAPD و تمامی نشانگر­های SCoT  چند شکلی نشان دادند. ماتریس فاصله ژنتیکی در محدوده ای بین ۰۱/۰ تا ۳۷/۰  برای نشانگر RAPD و بین ۰۲/۰ تا ۵۲/۰ برای نشانگر SCoT محاسبه گردید. درصد چند شکلی نشانگرهای RAPD و نشانگر SCoT، ۱۰۰ درصد برآورد گردید که تقریبا مشابه بودند. به منظور بررسی روابط ژنتیکی از تجزیه خوشه­ای با روش Neighbor-Joining و با استفاده از نرم ­افزار Splits tree انجام شد. نشانگرهای RAPD و SCoT ارقام را به سه گروه تقسیم­بندی نمودند. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که نشانگر  SCoT نسبت به نشانگر RAPD با وضوح و تفکیک ­پذیری بالایی در شناسایی اطلاعات ژنومی دارد. این اولین گزارش آنالیز تنوع ژنتیکی آنتوریوم با استفاده از نشانگر SCoT بود. در مجموع، نتایج نشان داد که این نشانگرها اطلاعات سودمندی را برای محافظت منابع ژرم­پلاسم آنتوریوم فراهم می­ کنند و همچنین برای برنامه­ های اصلاح نباتات مفید می ­باشند.

نویسندگان

زهرا دانشور

Department of Science and Biotechnology, Faculty of Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran,

عباس سعیدی

Department of Science and Biotechnology, Faculty of Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran,

ابراهیم بیرامی زاده

Department of Genetics and Rape, Department of Flowers and Ornamental Plants, Institute of Horticulture, Research, Education and Promotion Center of Mahallat

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Al-Qurainy, F., S. Khan, M. Nadeem and M. Tarroum. ۲۰۱۵. ...
  • Andersen, J.R. and T. Lubberstedt. ۲۰۰۳. Functional markers in plants. ...
  • Collard, B.Y. and D. Mackill. ۲۰۰۹. Start Codon Targeted (SCoT) ...
  • Escudero, A., J.M. Iriondo and M.E. Torres. ۲۰۰۳. Spatial analysis ...
  • Feghhi, S.M.A., P. Norouzi, A. Saidi, K. Zamani and R. ...
  • Ghareyazi, B. ۱۹۹۶. Application of DNA markers in plant breeding. ...
  • Ghorbani Jamalabadi, J., A. Saidi, E. Karami, M. Kharkesh and ...
  • Gorji, A.M., P. Poczai, Z. Polgar and J. Taller. ۲۰۱۱. ...
  • Govaerts, R., G. Frodin, J. Bogner, P. Boyce, B. Cosgriff, ...
  • Hajibarat, Z., A. Saidi and R. Talebi. ۲۰۱۶. Evaluation of ...
  • Iruela, M., J.I. Rubio, J. Cubero, T. Gil and Milla'n. ...
  • Karami E., R. Talebi, M. Kharkesh and A. Saidi. ۲۰۱۵. ...
  • Luo, C. ۲۰۱۲. Genetic relationship and diversity of Mangifera indica ...
  • Mohammadi, S. and B.M. Prasanna. ۲۰۰۳. Analysis of genetic diversity ...
  • Naghavi, M., B. Ghareyazi and B.C. Hosseini Salak Deh. ۲۰۰۸. ...
  • Nebaure, S.G., L. Castillo-Agudo and J. Segura. ۱۹۹۹. RAPD variation ...
  • Noormohammadi, Z., A. Fasihee, S. Homaee-Rashidpoor, M. Sheidai, S. Ghasemzadeh ...
  • Pandey, S., S. Kumar, U. Mishra, A. Rai, M. Singh ...
  • Rabiei, V., M .Saadati, J. Azimkhani and R.S. Mohammadi. ۲۰۱۲. ...
  • Ranamukhaarachchi, D.G., R.J. Henny, C.L. Guy and Q.B. Li .۲۰۰۱. ...
  • Roldan-Ruiz, I., J. Dendauw, E .Van Bockstaele, A. Depicker and ...
  • Saghai-Maroof, M.A., K M. Soliman, R.A. Jorgensen and R.W. Allard.۱۹۸۴. ...
  • Sedaghati, B., N. Babaeian, N. Bagheri and H. Salehian Aghblaq. ...
  • Satya, P., M. Karan, S. Jana, S. Mitra, A. Sharma, ...
  • Stancato, G.C. and M.L.S. Tucci. ۲۰۱۰. Monitoring the end of ...
  • Upadhya, A., K. Jayadev, R. Manimekalai and V.A. Parthasarathy. ۲۰۰۴. ...
  • Wang, Q., B. Zhang and G. Lu .۲۰۰۹. Conserved region ...
  • Zali, H., O. Sofalian, T. Hasanloo, A. Asgharii and M. ...
  • Al-Qurainy, F., S. Khan, M. Nadeem and M. Tarroum. ۲۰۱۵. ...
  • Andersen, J.R. and T. Lubberstedt. ۲۰۰۳. Functional markers in plants. ...
  • Collard, B.Y. and D. Mackill. ۲۰۰۹. Start Codon Targeted (SCoT) ...
  • Escudero, A., J.M. Iriondo and M.E. Torres. ۲۰۰۳. Spatial analysis ...
  • Feghhi, S.M.A., P. Norouzi, A. Saidi, K. Zamani and R. ...
  • Ghareyazi, B. ۱۹۹۶. Application of DNA markers in plant breeding. ...
  • Ghorbani Jamalabadi, J., A. Saidi, E. Karami, M. Kharkesh and ...
  • Gorji, A.M., P. Poczai, Z. Polgar and J. Taller. ۲۰۱۱. ...
  • Govaerts, R., G. Frodin, J. Bogner, P. Boyce, B. Cosgriff, ...
  • Hajibarat, Z., A. Saidi and R. Talebi. ۲۰۱۶. Evaluation of ...
  • Iruela, M., J.I. Rubio, J. Cubero, T. Gil and Milla'n. ...
  • Karami E., R. Talebi, M. Kharkesh and A. Saidi. ۲۰۱۵. ...
  • Luo, C. ۲۰۱۲. Genetic relationship and diversity of Mangifera indica ...
  • Mohammadi, S. and B.M. Prasanna. ۲۰۰۳. Analysis of genetic diversity ...
  • Naghavi, M., B. Ghareyazi and B.C. Hosseini Salak Deh. ۲۰۰۸. ...
  • Nebaure, S.G., L. Castillo-Agudo and J. Segura. ۱۹۹۹. RAPD variation ...
  • Noormohammadi, Z., A. Fasihee, S. Homaee-Rashidpoor, M. Sheidai, S. Ghasemzadeh ...
  • Pandey, S., S. Kumar, U. Mishra, A. Rai, M. Singh ...
  • Rabiei, V., M .Saadati, J. Azimkhani and R.S. Mohammadi. ۲۰۱۲. ...
  • Ranamukhaarachchi, D.G., R.J. Henny, C.L. Guy and Q.B. Li .۲۰۰۱. ...
  • Roldan-Ruiz, I., J. Dendauw, E .Van Bockstaele, A. Depicker and ...
  • Saghai-Maroof, M.A., K M. Soliman, R.A. Jorgensen and R.W. Allard.۱۹۸۴. ...
  • Sedaghati, B., N. Babaeian, N. Bagheri and H. Salehian Aghblaq. ...
  • Satya, P., M. Karan, S. Jana, S. Mitra, A. Sharma, ...
  • Stancato, G.C. and M.L.S. Tucci. ۲۰۱۰. Monitoring the end of ...
  • Upadhya, A., K. Jayadev, R. Manimekalai and V.A. Parthasarathy. ۲۰۰۴. ...
  • Wang, Q., B. Zhang and G. Lu .۲۰۰۹. Conserved region ...
  • Zali, H., O. Sofalian, T. Hasanloo, A. Asgharii and M. ...
  • نمایش کامل مراجع