طراحی پلی توپ واکسن علیه ویبریو کلرا: رویکردی وارونه برای طراحی واکسن

طراحی واکسن درگذشته تا به امروز براساس روش­های کلاسیک صورت میگیرد که زمان­بر، هزینه­بر و دارای ملاحظاتی هستند، اما با کشف ژنوم و تعیین توالی ژن، روش­های مدرنی برای طراحی واکسن ابداع شده که از جمله آن می­توان به روش طراحی واکسن به روش معکوس اشاره کرد. در این پژوهش از سرور NCBI (ORF Finder) به منظور یافتن توالی­های  Coding و برای مکان­یابی پروتئین از سرور PSORTb  استفاده شده و بررسی آلرژنیک بودن پروتئین از سرور  Algpred و به منظور پیش­بینی اپی توپ خطی و فضایی از سرورهای  LBtope – ABCpred - IEDB CBTOPE - Disco Tope ۲.۰ – IEDB (Ellipro) اپی توپ نهایی انتخاب شده و سپس تجزیه و تحلیل سازه پلی توپی را توسط سرور ExPasy (ProtParam) بررسی کردیم و در نهایت با سرور JCat  توالی نوکلئوتیدی بهینه شده را بدست آوردیم. با استفاده از این روش ۶۰۷۴ چارچوب خوانش و همچنین ۴۳ پروتیین سطحی و ترشحی شناسایی گردیده که در نهایت، ۱۰ اپی توپ مناسب به عنوان کاندیدای واکسن قادر به ایجاد ایمنی در برابر طیف وسیعی از سویه­ها می باشند، امید است که راه پیشرفت تولید این واکسن را بسیار آسان کنند.

کلیدواژه ها:

bioinformatics ، polytope vaccine ، protein ، agent of cholera ، ‎reverse vaccinology ، بیوانفورماتیک ، سازه پلی توپی ، پروتئین ، عامل وبا ، واکسن سازی به روش معکوس